Dynamics of Protein–Ligand Interactions

Informations projet

DynaPLIX

N° de convention de subvention: 101071843

DOI

10.3030/101071843

Date de signature de la CE 17 Février 2023

Date de début 1 Mai 2023

Date de fin 30 Avril 2029

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 8 721 625,00

Contribution de l’UE

€ 8 721 625,00

Coordonné par

LUNDS UNIVERSITET
Sweden

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (8)

Ligand-induced protein transition state stabilization switches the binding pathway from conformational selection to induced fit

Auteurs: Olof Stenström, Carl Diehl, Kristofer Modig, Mikael Akke
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2317747121

Machine Learning-Enhanced Calculation of Quantum-Classical Binding Free Energies

Auteurs: Moritz Bensberg, Marco Eckhoff, F. Emil Thomasen, William Bro-Jørgensen, Matthew S. Teynor, Valentina Sora, Thomas Weymuth, Raphael T. Husistein, Frederik E. Knudsen, Anders Krogh, Kresten Lindorff-Larsen, Markus Reiher, Gemma C. Solomon
Publié dans: Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 21, 2025, ISSN 1549-9618
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C00388

Spitrobot-2 advances time-resolved cryo-trapping crystallography to under 25 ms

Auteurs: Maria Spiliopoulou, Caitlin E. Hatton, Martin Kollewe, Jan-Philipp Leimkohl, Hendrik Schikora, Friedjof Tellkamp, Pedram Mehrabi, Eike C. Schulz
Publié dans: Communications Chemistry, Numéro 8, 2025, ISSN 2399-3669
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42004-025-01784-9

Binding mode of Isoxazolyl Penicillins to a Class-A β-lactamase at ambient conditions

Auteurs: Gargi Gore, Andreas Prester, David von Stetten, Kim Bartels, Eike C. Schulz
Publié dans: Communications Chemistry, Numéro 8, 2025, ISSN 2399-3669
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42004-025-01801-X

Probing the modulation of enzyme kinetics by multi-temperature, time-resolved serial crystallography

Auteurs: Eike C. Schulz, Andreas Prester, David von Stetten, Gargi Gore, Caitlin E. Hatton, Kim Bartels, Jan-Philipp Leimkohl, Hendrik Schikora, Helen M. Ginn, Friedjof Tellkamp, Pedram Mehrabi
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-61631-2

Structure-Based Experimental Datasets for Benchmarking Protein Simulation Force Fields [Article v1.0]

Auteurs: Chapin E. Cavender, David A. Case, Julian C.-H. Chen, Lillian T. Chong, Daniel A. Keedy, Kresten Lindorff-Larsen, David L. Mobley, O. H. Samuli Ollila, Chris Oostenbrink, Paul J. Robustelli, Vincent A. Voelz, Michael E. Wall, David C. Wych, Michael K. Gilson
Publié dans: Living Journal of Computational Molecular Science, Numéro 6, 2026, ISSN 2575-6524
Éditeur: University of Colorado at Boulder
DOI: 10.33011/LIVECOMS.6.1.3871

Hierarchical Quantum Embedding by Machine Learning for Large Molecular Assemblies

Auteurs: Moritz Bensberg, Marco Eckhoff, Raphael T. Husistein, Matthew S. Teynor, Valentina Sora, William Bro-Jørgensen, F. Emil Thomasen, Anders Krogh, Kresten Lindorff-Larsen, Gemma C. Solomon, Thomas Weymuth, Markus Reiher
Publié dans: Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 21, 2025, ISSN 1549-9618
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C00389

Integrative modelling of biomolecular dynamics

Auteurs: Daria Gusew, Carl G. Henning Hansen, Kresten Lindorff-Larsen
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 96, 2026, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103195