Dynamics of Protein–Ligand Interactions

Informacje na temat projektu

DynaPLIX

Identyfikator umowy o grant: 101071843

DOI

10.3030/101071843

Data podpisania przez KE 17 Lutego 2023

Data rozpoczęcia 1 Maja 2023

Data zakończenia 30 Kwietnia 2029

Finansowanie w ramach

• European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 8 721 625,00

Wkład UE

€ 8 721 625,00

Koordynowany przez

LUNDS UNIVERSITET
Sweden

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

Ligand-induced protein transition state stabilization switches the binding pathway from conformational selection to induced fit

Autorzy: Olof Stenström, Carl Diehl, Kristofer Modig, Mikael Akke
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 121, 2024, ISSN 0027-8424
Wydawca: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2317747121

Machine Learning-Enhanced Calculation of Quantum-Classical Binding Free Energies

Autorzy: Moritz Bensberg, Marco Eckhoff, F. Emil Thomasen, William Bro-Jørgensen, Matthew S. Teynor, Valentina Sora, Thomas Weymuth, Raphael T. Husistein, Frederik E. Knudsen, Anders Krogh, Kresten Lindorff-Larsen, Markus Reiher, Gemma C. Solomon
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 21, 2025, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C00388

Spitrobot-2 advances time-resolved cryo-trapping crystallography to under 25 ms

Autorzy: Maria Spiliopoulou, Caitlin E. Hatton, Martin Kollewe, Jan-Philipp Leimkohl, Hendrik Schikora, Friedjof Tellkamp, Pedram Mehrabi, Eike C. Schulz
Opublikowane w: Communications Chemistry, Numer 8, 2025, ISSN 2399-3669
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42004-025-01784-9

Binding mode of Isoxazolyl Penicillins to a Class-A β-lactamase at ambient conditions

Autorzy: Gargi Gore, Andreas Prester, David von Stetten, Kim Bartels, Eike C. Schulz
Opublikowane w: Communications Chemistry, Numer 8, 2025, ISSN 2399-3669
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42004-025-01801-X

Probing the modulation of enzyme kinetics by multi-temperature, time-resolved serial crystallography

Autorzy: Eike C. Schulz, Andreas Prester, David von Stetten, Gargi Gore, Caitlin E. Hatton, Kim Bartels, Jan-Philipp Leimkohl, Hendrik Schikora, Helen M. Ginn, Friedjof Tellkamp, Pedram Mehrabi
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-61631-2

Structure-Based Experimental Datasets for Benchmarking Protein Simulation Force Fields [Article v1.0]

Autorzy: Chapin E. Cavender, David A. Case, Julian C.-H. Chen, Lillian T. Chong, Daniel A. Keedy, Kresten Lindorff-Larsen, David L. Mobley, O. H. Samuli Ollila, Chris Oostenbrink, Paul J. Robustelli, Vincent A. Voelz, Michael E. Wall, David C. Wych, Michael K. Gilson
Opublikowane w: Living Journal of Computational Molecular Science, Numer 6, 2026, ISSN 2575-6524
Wydawca: University of Colorado at Boulder
DOI: 10.33011/LIVECOMS.6.1.3871

Hierarchical Quantum Embedding by Machine Learning for Large Molecular Assemblies

Autorzy: Moritz Bensberg, Marco Eckhoff, Raphael T. Husistein, Matthew S. Teynor, Valentina Sora, William Bro-Jørgensen, F. Emil Thomasen, Anders Krogh, Kresten Lindorff-Larsen, Gemma C. Solomon, Thomas Weymuth, Markus Reiher
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 21, 2025, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C00389

Integrative modelling of biomolecular dynamics

Autorzy: Daria Gusew, Carl G. Henning Hansen, Kresten Lindorff-Larsen
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 96, 2026, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103195