Objectif
Our overall objectives are to accelerate the diagnosis, and enable personalised management, of inherited metabolic diseases (IMDs). Established academic technology for statistical genomic analysis, deep learning-based prediction of protein structure, and whole-body metabolic network modelling shall be applied to generate personalised computational models, given patient-derived genomic, transcriptomic, proteomic and metabolomic data. To train diagnostic models, a comprehensive clinical team will recruit 1,945 diagnosed patients with a wide variety of IMDs, then validate the clinical utility of personalised computational models on a set of 685 undiagnosed patients. An enhanced human metabolic network reconstruction, especially for lipid metabolism, reaction kinetics and inherited metabolic disease pathways, will increase the predictive capacity of cellular and whole-body metabolic network models. As an exemplar for other IMDs, personalised computational modelling will be used to identify compensatory and aggravating mechanisms that associate with clinical severity in Gaucher disease. The predictive capacity of personalised models will be validated by comparison with additional empirical investigations of protein structure and function as well as metabolomics, tracer-based metabolomics and proteomics of patient-derived in vitro disease models. To maximise the potential for impact, personalised modelling software will be developed to be generally applicable to a broad variety of IMDs, and implemented in a way that is both accessible to clinicians and admissible to regulatory authorities. Sustainability will be promoted by development of a roadmap for a European foundation to aid personalised diagnosis and management of IMDs, informed by broad stakeholder consultation. This is a unique opportunity to realise the potential of personalised computational modelling for a broad set of rare diseases, which is a field where European collaboration is an essential for progress.
Champ scientifique
- natural sciencescomputer and information sciencessoftware
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsproteomics
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculeslipids
- engineering and technologyelectrical engineering, electronic engineering, information engineeringinformation engineeringtelecommunicationstelecommunications networksdata networks
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation ActionsCoordinateur
H91 Galway
Irlande
Voir sur la carte
Participants (28)
33100 Udine
Voir sur la carte
72074 Tuebingen
Voir sur la carte
49074 Osnabrueck
Voir sur la carte
9713 GZ Groningen
Voir sur la carte
2311 EZ Leiden
Voir sur la carte
A91 Dundalk
Voir sur la carte
69120 Heidelberg
Voir sur la carte
00162 Roma
Voir sur la carte
81675 Muenchen
Voir sur la carte
D08 HP97 Dublin
Voir sur la carte
30625 Hannover
Voir sur la carte
00165 Roma
Voir sur la carte
1081 HV Amsterdam
Voir sur la carte
1090 Wien
Voir sur la carte
7 Dublin
Voir sur la carte
2650 Edegem
Voir sur la carte
50139 Firenze
Voir sur la carte
55131 Mainz
Voir sur la carte
48903 Barakaldo Bizkaia
Voir sur la carte
15706 Santiago De Compostela
Voir sur la carte
462 80 Vanersborg
Voir sur la carte
3584 CX Utrecht
Voir sur la carte
3400 Hillerod
Voir sur la carte
0450 Oslo
Voir sur la carte
12808 Praha 2
Voir sur la carte
79106 Freiburg
Voir sur la carte
3000 Leuven
Voir sur la carte
3015 GD Rotterdam
Voir sur la carte
Partenaires (5)
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
1206 Geneve
Voir sur la carte
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
NE1 7RU Newcastle Upon Tyne
Voir sur la carte
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
OX1 2JD Oxford
Voir sur la carte
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
WC1E 6BT London
Voir sur la carte
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
BT9 7AS Belfast
Voir sur la carte