Objetivo
Pathogens use antigenic variation to evade host antibodies and cause diseases in humans. Interestingly, in many species antigen switching occurs non-randomly in a hierarchical manner, with specific antigen genes selected in succession. Trypanosoma brucei is a key model organism for the study of antigenic variation in which antigen switching hierarchies of its Variant Surface Glycoprotein (VSG) genes operate. However, how exactly this hierarchy is determined is unknown. Studies in T. brucei have indicated that the spatial positioning of VSG genes within the nucleus is important for controlling their activation. However, to date no systematic investigation of VSG gene nuclear positioning and antigen switching hierarchies has been performed.
In this project, I would test the hypothesis that antigen switching hierarchies in trypanosomes are mediated by the spatial positioning of VSG genes in the nucleus. Using T. brucei cell lines in which different antigen switching pathways can be induced, I will determine whether silent VSGs in close spatial proximity to the active VSG before switch induction are selected next in the antigen switching pathway. This will be investigated by integrating a combination of Micro-C to monitor VSG nuclear positioning before and after switching followed by scRNA-seq. I will also develop a dCas9 artificial tethering system to tether silent VSGs either towards or away from the active VSG before switch induction to create a synthetic VSG switching hierarchy.
These experiments will generate important insights into the mechanisms which control antigen switching and provide valuable tools for studying nuclear organisation in kinetoplastid parasites.
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
80539 MUNCHEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.