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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Single-cell sequencing analysis of striatal gene regulatory networks in Parkinson's disease

Objectif

Parkinson’s disease (PD) is the fastest growing Neurodegenerative disorder, currently affecting an estimate of 7 to 10 million people worldwide. The disease is characterized by the loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra and the accumulation of protein aggregates in the remaining ones. The loss of these cells leads to a dopamine deficit in the striatum which causes the motor symptoms characteristic of PD and the general malfunction of the neuronal circuitry in the basal ganglia. The existing treatment for PD is dopamine replacement therapy with levodopa. This drug alleviates the motor symptoms but has a number of side effects, loses efficacy with time and does not address the cognitive decline caused by PD. In order to gain a better understanding of the disease and open new paths towards an effective treatment, the PARKSEQ project will use the latest advanced in single-cell RNA sequencing and in situ hybridization to determine which cell-type specific gene regulatory networks (GRNs) are affected by PD in the striatum. To this end, I will use single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to study post-mortem human striatum samples from PD and control subjects, under the supervision and guidance of Ana Muñoz, a leading expert in PD and scRNA-seq studies. I will draw from my experience in Bioinformatics and in single cell data analysis to determine the cell types and subtypes existing in the human striatum. On each subtype, I will establish which genes are differentially expressed and, considering their co-expression, I will formulate putative altered GRNs. Then, during a secondment period, I will join Mats Nilsson laboratory to validate the scRNA-seq findings using in situ hybridization. Dr. Nilsson has advanced this technique making it possible to use verify the presence of over 100 genes simultaneously on intact tissue slices. This will enable me to verify the PD-induced alterations in the GRNs suggested by the scRNA-seq data.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSIDAD DE CADIZ
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 165 312,96
Adresse
CENTRO CULTURAL REINA SOFIA PASEO CARLOS III N9
11003 Cadiz
Espagne

Voir sur la carte

Région
Sur Andalucía Cádiz
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Partenaires (1)

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