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Using an organoid model to understand epithelial immunity in IBD

Descripción del proyecto

Organoides del intestino delgado humano: los enterocitos en la enfermedad inflamatoria intestinal

La enfermedad inflamatoria intestinal (EII) se caracteriza por la inflamación del tracto gastrointestinal causada por una respuesta inmunitaria desregulada a la infección bacteriana intestinal. El mecanismo subyacente a esta desregulación no está claro. Sin embargo, cada vez se presta más atención al papel de los enterocitos en el control de la microbiota intestinal. Con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, el equipo del proyecto Epi-IBD establecerá un modelo «in vitro» de EII basado en organoides del intestino delgado humano compuestos por células intestinales diferenciadas. El equipo lo utilizará para estudiar cómo responde el epitelio intestinal a la infección bacteriana en el contexto de la EII, evaluando tanto una conocida predisposición genética a la EII como mecanismos novedosos.

Objetivo

As the first line of defense against intestinal pathogens, gut epithelial cells are an essential part of the immune system. They may play an important role in immune-mediated diseases such as Inflammatory Bowel Disease (IBD). IBD is a group of disorders characterized by chronic inflammation of the gastrointestinal tract. IBD prevalence is high in Western countries (0.3% in 2018) and it is rising in newly industrialized countries.
A prevailing model is that the interplay of two factors may cause IBD. First, a genetic predisposition weakens the gut immune system and causes high susceptibility to bacterial infection. Second, pathogenic bacteria infect the gut and trigger chronic inflammation.
It is still unclear how the gut immune system may fail to repress bacterial infection in IBD. Historically, most studies have been focusing on immune cells of the hematopoietic lineage, such as macrophages and lymphocytes. However, the role of gut epithelial cells in controlling gut microbes is now gaining increasing attention. In this project, I propose to use organoids composed of differentiated intestinal cells to study how the intestinal epithelium responds to bacterial infection in the context of IBD.
I will establish an in vitro model of IBD based on human small intestine organoids. I will infect the organoids with the bacterium Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC) and study how the differentiated intestinal cells respond to AIEC invasion. I will both test the relevance of a well-known IBD genetic predisposition (the mutation 1007fs in Nucleotide-binding oligomerization domain 2 (Nod2)) and explore novel mechanisms underlying the immune response of gut epithelial cells using RNAseq and CRISPR base editing. My project will dissect the molecular mechanisms of IBD. In addition, it will improve our understanding of the immune response of epithelial cells, which are an under-studied component of the immune system.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

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Coordinador

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 187 624,32
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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