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Using an organoid model to understand epithelial immunity in IBD

Description du projet

Organoïdes de l’intestin grêle humain: les cellules épithéliales de l’intestin dans la maladie inflammatoire chronique de l'intestin

La maladie inflammatoire chronique de l’intestin (MICI) se caractérise par une inflammation de l’appareil digestif causée par une réponse immunitaire dysfonctionnelle à une infection bactérienne intestinale. Le mécanisme sous-jacent à cette dysrégulation n’est pas clair. Cependant, le rôle des cellules épithéliales de l’intestin dans le contrôle des microbes intestinaux fait l’objet d’une attention croissante. Le projet Epi-IBD, soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, entend établir un modèle in vitro de MICI basé sur des organoïdes d’intestin grêle humain composés de cellules intestinales différenciées. L’équipe s’en servira pour étudier la manière dont l’épithélium intestinal réagit à l’infection bactérienne dans le contexte de la MICI, en évaluant à la fois une prédisposition génétique bien connue à la MICI et de nouveaux mécanismes.

Objectif

As the first line of defense against intestinal pathogens, gut epithelial cells are an essential part of the immune system. They may play an important role in immune-mediated diseases such as Inflammatory Bowel Disease (IBD). IBD is a group of disorders characterized by chronic inflammation of the gastrointestinal tract. IBD prevalence is high in Western countries (0.3% in 2018) and it is rising in newly industrialized countries.
A prevailing model is that the interplay of two factors may cause IBD. First, a genetic predisposition weakens the gut immune system and causes high susceptibility to bacterial infection. Second, pathogenic bacteria infect the gut and trigger chronic inflammation.
It is still unclear how the gut immune system may fail to repress bacterial infection in IBD. Historically, most studies have been focusing on immune cells of the hematopoietic lineage, such as macrophages and lymphocytes. However, the role of gut epithelial cells in controlling gut microbes is now gaining increasing attention. In this project, I propose to use organoids composed of differentiated intestinal cells to study how the intestinal epithelium responds to bacterial infection in the context of IBD.
I will establish an in vitro model of IBD based on human small intestine organoids. I will infect the organoids with the bacterium Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC) and study how the differentiated intestinal cells respond to AIEC invasion. I will both test the relevance of a well-known IBD genetic predisposition (the mutation 1007fs in Nucleotide-binding oligomerization domain 2 (Nod2)) and explore novel mechanisms underlying the immune response of gut epithelial cells using RNAseq and CRISPR base editing. My project will dissect the molecular mechanisms of IBD. In addition, it will improve our understanding of the immune response of epithelial cells, which are an under-studied component of the immune system.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 187 624,32
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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