Description du projet
Profilage des interactions ARN-protéines dans l’infection par le virus respiratoire syncytial
Le virus respiratoire syncytial (VRS) touche environ 64 millions de personnes par an, causant plus de 150 000 décès. Les enfants de moins de cinq ans et les personnes âgées sont plus vulnérables à cette grave pathologie. Malgré son impact considérable sur la santé publique, la mise au point de vaccins et d’antiviraux s’est avérée compliquée en raison de la complexité des mécanismes de multiplication du virus, de ses interactions avec l’hôte et de sa pathogénicité. Le projet PARIS, soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, se propose de cartographier de manière exhaustive les interactions entre le VRS et l’hôte, en particulier les interactions ARN-protéines, et à caractériser la réponse cellulaire à l’infection. Pour ce faire, l’équipe s’appuiera sur une approche protéomique et transcriptomique intégrée dans des paradigmes expérimentaux similaires à une infection naturelle.
Objectif
Respiratory Syncytial Virus (RSV) is a major cause of severe lower respiratory tract infections and a major cause of mortality in children under 5 years old and the elderly worldwide. While RSV impose a huge disease burden on public healthcare system, the development of effective vaccines and specific antivirals is impeded by a lack of knowledge of virus multiplications mechanisms, virus-host interactions or pathogenicity. Here, we propose to comprehensively map RSV-host interactions and characterize the cellular response to infection through an integrated multi-omics approach and using experimental systems close to natural infection. This project will combine my expertise in RSV biology and the host laboratory’s profound experience in systems biology analysis. By using state-of-the-art-of proteomics and transcriptomics, we will characterize the RSV RNA-bound proteome as well as the protein-protein interactome, analyze the proteome of cells expressing the individual viral proteins (effectome), and assess the influence of RSV infection on cellular mRNA expression, protein abundance, and phosphorylation. We will systematically map the identified viral-induced perturbations onto a network of known cellular protein-protein interactions and signalling pathways. This comprehensive network will highlight RSV-induced perturbations and pinpoint RSV host dependency-factors, whose functional importance and therapeutic potential will be assessed by conducting genetic and drug-based loss and gain of function experiments. Biochemical and structural methods, and further analyses of the cellular response in genetically or drug-perturbed cells will yield insights into the molecular function of selected proteins. The proposed multilevel approach will thus reveal yet unstudied proteins and pathways determining RSV growth, pathology or viral host defense mechanisms, which will shed light on unresolved questions of RSV biology, and reveal hotspots amenable to therapeutic intervention.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par l'équipe qui en a la charge.
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La classification de ce projet a été validée par l'équipe qui en a la charge.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences sociales sociologie démographie mortalité
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pathologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
80333 Muenchen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.