Description du projet
Comprendre la communication des champignons individuels dans le sol
Les champignons n’ont peut-être pas de cerveau, mais ils perçoivent, apprennent et prennent des décisions en permanence par le biais d’un large éventail de signaux chimiques. Lorsque plusieurs espèces de champignons coexistent dans les sols, la communication à l’échelle de la cellule unique se fait par l’intermédiaire des métabolites secondaires. Cette communication très rapide et localisée a un impact important sur les cycles biogéochimiques, mais son étude demeure complexe. Le projet INTERSPEC, financé par le CER, se propose d’utiliser la microspectroscopie de diffusion Raman exaltée par effet de surface (SERS) pour identifier et caractériser les métabolites secondaires fongiques dans les puces de sol basées sur la microfluidique. Ces outils devraient permettre de mieux comprendre la manière dont la composition des métabolomes secondaires et leurs fonctions changent en fonction des conditions nutritives. À terme, l’analyse du transcriptome mettra en lumière les gènes apparentés et les autres composés extracellulaires, tels que les enzymes, impliqués.
Objectif
Multiple species of fungi co-exist in soils and play an important role in biogeochemical cycles. To survive in a resource limited environment, they have developed the means for interspecific communication and warfare via an arsenal of secreted secondary metabolites. Specific ecological role of those metabolites and the extent to which they affect biogeochemical cycling during fungal interactions remains unknown. Because they are secreted and act at a single-cell scale, tracing them ‘then and there’ can aid in identifying potential triggers for their production and clarifying their function. Currently used methods have either insufficient resolution or are destructive, and are not suitable for such analyses. Here, I will use my expertise in spectroscopy techniques to (1) establish experimental protocols for the single-cell scale fungal secondary metabolite identification and characterization using surface-enhanced Raman scattering (SERS) microspectroscopy - a method that employs optical properties of gold nanoparticles for molecule specific sensing and that has been shown in biomedical research to have an extraordinary potential for studying microbial metabolic processes. I will combine it with microfluidics based soil chips, that provide visual access to and mimic real ecosystems via control over biotic and abiotic environment of soil microbes. Ultimately, my aim is to offer the community of soil fungal ecologists with a game-changing new tool to study ecosystem functions of secondary metabolites in more realistic settings. I will then use the approach to (2) determine how interspecific fungal interactions under varying nutrient conditions affect the composition of their secondary metabolome and its functions live and at single-cell scale. Additional transcriptome analysis will (3) reveal fungal genes involved in up- or downregulation of the metabolite biosynthesis, but also extracellular enzyme production for organic matter degradation and nutrient acquisition.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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La classification de ce projet a été validée par des humains.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences biologiques écologie écosystème
- ingénierie et technologie nanotechnologie nanomatériaux
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géochimie biogéochimie
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2023-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
6708 PB Wageningen
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.