Projektbeschreibung
Erforschen, wie einzelne Pilze im Boden kommunizieren
Pilze haben zwar kein Gehirn, aber mithilfe einer breiten Palette chemischer Signale nehmen sie ständig wahr, lernen sie und treffen sie Entscheidungen. Wenn mehrere Pilzarten in Böden koexistieren, findet die Kommunikation auf der Ebene einzelner Zellen über Sekundärmetaboliten statt. Diese sehr schnelle und örtlich begrenzte Kommunikation hat erhebliche Auswirkungen auf die biogeochemischen Kreisläufe, ist aber schwer zu erforschen. Das Ziel des ERC-finanzierten Projekts INTERSPEC lautet, die Mikrospektroskopie mit oberflächenverstärkter Ramanstreuung zur Identifizierung und Charakterisierung von Pilz-Sekundärmetaboliten in mikrofluidikbasierten Bodenchips einzusetzen. Mit diesen Instrumenten sollte erkundet werden können, wie sich die Zusammensetzung der Sekundärmetabolome und ihre Funktionen unter verschiedenen Nährstoffbedingungen verändern. Letztlich wird die Transkriptomanalyse Aufschluss über verwandte Gene und weitere extrazelluläre Verbindungen, etwa Enzyme, geben.
Ziel
Multiple species of fungi co-exist in soils and play an important role in biogeochemical cycles. To survive in a resource limited environment, they have developed the means for interspecific communication and warfare via an arsenal of secreted secondary metabolites. Specific ecological role of those metabolites and the extent to which they affect biogeochemical cycling during fungal interactions remains unknown. Because they are secreted and act at a single-cell scale, tracing them ‘then and there’ can aid in identifying potential triggers for their production and clarifying their function. Currently used methods have either insufficient resolution or are destructive, and are not suitable for such analyses. Here, I will use my expertise in spectroscopy techniques to (1) establish experimental protocols for the single-cell scale fungal secondary metabolite identification and characterization using surface-enhanced Raman scattering (SERS) microspectroscopy - a method that employs optical properties of gold nanoparticles for molecule specific sensing and that has been shown in biomedical research to have an extraordinary potential for studying microbial metabolic processes. I will combine it with microfluidics based soil chips, that provide visual access to and mimic real ecosystems via control over biotic and abiotic environment of soil microbes. Ultimately, my aim is to offer the community of soil fungal ecologists with a game-changing new tool to study ecosystem functions of secondary metabolites in more realistic settings. I will then use the approach to (2) determine how interspecific fungal interactions under varying nutrient conditions affect the composition of their secondary metabolome and its functions live and at single-cell scale. Additional transcriptome analysis will (3) reveal fungal genes involved in up- or downregulation of the metabolite biosynthesis, but also extracellular enzyme production for organic matter degradation and nutrient acquisition.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Mykologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Ökologie Ökosystem
- Technik und Technologie Nanotechnologie Nanomaterialien
- Naturwissenschaften Geowissenschaften und verwandte Umweltwissenschaften Geochemie Biogeochemie
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Spektroskopie
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
6708 PB Wageningen
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.