Objetivo
The dynamics of biological systems, from proteins to cells to organisms, is complex and stochastic. To decipher their physical laws, we need to bridge between experimental observations and theoretical modeling. Thanks to progress in microscopy and tracking, there is today an abundance of experimental trajectories reflecting these dynamical laws. Inferring physical models from noisy and imperfect experimental data, however, is challenging. Because there are no inference methods that are robust and efficient, model reconstruction from experimental trajectories is a bottleneck to data-driven biophysics.
I will bridge this gap by developing practical algorithms that permit robust and universal inference of stochastic dynamical models from experimental trajectories. To this aim, I will build data-efficient tools to learn stochastic differential equations and discover physical models, employing methods from statistical physics and machine learning. The main focus of SuperStoc will be in resolving models with high precision from limited trajectories. To assess the efficiency of the methods I develop, I will design information-theoretical frameworks to quantify how much can be inferred from trajectories that are short, partial and noisy. The convergence of the resulting algorithms will be backed by mathematical proofs and numerical simulations in realistic conditions.
I will apply these new tools to several key open biophysical problems where existing methods are failing: condensate-mediated interactions between genomic loci, cellular mechanosensing in confined environments, pattern formation in embryo development, and visual interaction between fish leading to collective motion.
The resulting algorithms will be implemented into a software designed to be useful for the broad soft biological matter community. By proving that one can do more with the same data and providing tools to do so, SuperStoc will help bridge the inference gap towards data-driven biophysics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información software
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales ciencias biológicas biofísica
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica embriología
- ciencias sociales derecho
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75794 PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.