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Translation in cellular context: Elucidating function, organization and regulation with near-atomic models in whole cells

Descripción del proyecto

Experimentos y modelos para revelar los mecanismos de regulación de la traducción con detalles casi atómicos

La síntesis de proteínas, durante la cual la secuencia de nucleótidos de los ARNm se traduce en una secuencia de aminoácidos, es catalizada por los millones de ribosomas de una célula humana. Los ribosomas están regulados por una plétora de proteínas. Se desconoce en gran parte la composición de estos complejos reguladores, sus funciones, su distribución y cómo cambian en respuesta al estrés celular. El equipo del proyecto TransFORM, financiado por el CEI, pretende colmar estas lagunas con tecnologías nuevas, como la tomografía crioelectrónica, la espectrometría de masas de reticulación y la modelización estructural integradora. En sistemas que abarcan desde las células humanas individuales hasta los organoides, el equipo planea revelar la estructura y composición de los complejos de traducción y los mecanismos reguladores a través del espacio celular en la adaptación a los factores estresantes y a la infección vírica.

Objetivo

Translation – the fundamental process of protein synthesis catalyzed by ribosomes - has been extensively characterized from a biochemical, structural, and mechanistic perspective. However, how exactly the translation machinery operates as an interconnected system of millions of ribosomes in cells is poorly understood. Within the cell, ribosomes associate with a multitude of regulatory proteins forming a variety of specialized complexes and distributing across cellular space in a manner that depends on cell state. What is the specific composition of those complexes, their significance, and their functional role? How are they defined and regulated by subcellular compartmentalization? How do they change in response to cellular stress? Our TransFORM synergy team brings together experts in method development for in-cell structural biology and the biology of translation to allow us for the first time to attack these fundamental problems. Building on our prior achievements, we aim to synergistically develop novel methods of cryo-electron tomography with imaging across scales in conjunction with crosslinking mass spectrometry and integrative structural modeling for near-atomic structure determination directly in cells. TransFORM will determine the ribosome structural and functional states across the translation cycle in human cells, following distinct 40S, 80S, and disomal particles (80S+80S), in and out of polysomes and across different protein synthesis regimes. We will uncover structural and compositional changes and regulatory mechanisms across cellular space, in adaptation to perturbations by stressors and during viral infection. Our model systems will span from single cells to organoids. TransFORM will provide a detailed and comprehensive in-cell map of the essential process of protein synthesis while delivering innovative methods for the next-generation of in-cell structural biology.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-SyG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 7 135 726,00
Dirección
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Alemania

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Región
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 7 135 726,00

Beneficiarios (3)

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