Descrizione del progetto
Esperimenti e modelli per rivelare i meccanismi di regolazione della traduzione con risoluzione quasi atomica
La sintesi proteica, durante la quale la sequenza di nucleotidi negli mRNA viene tradotta in una sequenza di amminoacidi, è catalizzata dai milioni di ribosomi presenti nelle cellule umane, particelle regolate da una moltitudine di proteine. La composizione di questi complessi regolatori, le loro funzioni, la distribuzione che li caratterizza e il modo in cui cambiano in risposta allo stress cellulare sono in gran parte sconosciuti. Il progetto TransFORM, finanziato dal CER, si propone di colmare queste lacune mediante l’implementazione di nuove tecnologie, tra cui la tomografia crioelettronica, la spettrometria di massa a reticolazione e la modellizzazione strutturale integrativa. Analizzando sistemi che vanno da singole cellule umane a organoidi, il team intende rivelare la struttura e la composizione dei complessi di traduzione e dei meccanismi di regolazione nello spazio cellulare in relazione all’adattamento a fattori di stress e infezioni virali.
Obiettivo
Translation – the fundamental process of protein synthesis catalyzed by ribosomes - has been extensively characterized from a biochemical, structural, and mechanistic perspective. However, how exactly the translation machinery operates as an interconnected system of millions of ribosomes in cells is poorly understood. Within the cell, ribosomes associate with a multitude of regulatory proteins forming a variety of specialized complexes and distributing across cellular space in a manner that depends on cell state. What is the specific composition of those complexes, their significance, and their functional role? How are they defined and regulated by subcellular compartmentalization? How do they change in response to cellular stress? Our TransFORM synergy team brings together experts in method development for in-cell structural biology and the biology of translation to allow us for the first time to attack these fundamental problems. Building on our prior achievements, we aim to synergistically develop novel methods of cryo-electron tomography with imaging across scales in conjunction with crosslinking mass spectrometry and integrative structural modeling for near-atomic structure determination directly in cells. TransFORM will determine the ribosome structural and functional states across the translation cycle in human cells, following distinct 40S, 80S, and disomal particles (80S+80S), in and out of polysomes and across different protein synthesis regimes. We will uncover structural and compositional changes and regulatory mechanisms across cellular space, in adaptation to perturbations by stressors and during viral infection. Our model systems will span from single cells to organoids. TransFORM will provide a detailed and comprehensive in-cell map of the essential process of protein synthesis while delivering innovative methods for the next-generation of in-cell structural biology.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2023-SyG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
69117 Heidelberg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.