Learning the interaction rules of antibody-antigen binding

Información del proyecto

AB-AG-INTERACT

Identificador del acuerdo de subvención: 101125630

DOI

10.3030/101125630

Fecha de la firma de la CE 4 Diciembre 2023

Fecha de inicio 1 Enero 2024

Fecha de finalización 31 Diciembre 2028

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 000 000,00

Aportación de la UE

€ 2 000 000,00

Coordinado por

UNIVERSITETET I OSLO
Norway

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Publicaciones

Peer reviewed articles (5)

PEPE: scalable extraction of multi-modal protein language model representations

Autores: Jahn Zhong, Niccolò Cardente, Geir Kjetil Sandve, Habib Bashour, Maria Francesca Abbate, Victor Greiff
Publicado en: Bioinformatics, Edición 42, 2026, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAG375

From virtual experiments to biomedical insight with synthetic data

Autores: Margarida Victoriano, Milena Pavlović, Geir Kjetil Sandve, Hélder P. Oliveira, Artur Rocha, Victor Greiff
Publicado en: Nature Machine Intelligence, Edición 8, 2026, ISSN 2522-5839
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42256-026-01244-6

Systematic benchmarking of mass spectrometry-based antibody sequencing reveals methodological biases

Autores: Maria Chernigovskaya, Khang Lê Quý, Maria Stensland, Sachin Singh, Rowan Nelson, Melih Yilmaz, Konstantinos Kalogeropoulos, Pavel Sinitcyn, Anand Patel, Natalie Castellana, Stefano Bonissone, Stian Foss, Jan Terje Andersen, Geir Kjetil Sandve, Timothy Patrick Jenkins, William S. Noble, Tuula A. Nyman, Igor Snapkow, Victor Greiff
Publicado en: Cell Systems, Edición 16, 2026, ISSN 2405-4712
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CELS.2025.101449

Identification of a type 1 diabetes–associated T cell receptor repertoire signature from the human peripheral blood

Autores: Rawat, Puneet and Shapiro, Melanie R and Peters, Leeana D and Widrich, Michael and Mayer-Blackwell, Koshlan and Motwani, Keshav and Pavlovi{\'c}, Milena and Al Hajj, Ghadi and Posgai, Amanda L and Kanduri, Chakravarthi and others
Publicado en: Science Advances, ISSN 2375-2548
Editor: Science Advances
DOI: 10.1126/SCIADV.ADX744

Training data composition determines machine learning generalization and biological rule discovery

Autores: Eugen Ursu; Aygul Minnegalieva; Puneet Rawat; Maria Chernigovskaya; Robi Tacutu; Geir Kjetil Sandve; Philippe A. Robert; Victor Greiff
Publicado en: Nature Machine Intelligence, 2025, ISSN 2522-5839
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2024.06.17.599333