Description du projet
Anticiper l’évolution des agents pathogènes
L’émergence de mutations résistantes aux médicaments constitue un formidable défi pour la lutte contre les agents pathogènes. La pression sélective exercée par les traitements pharmacologiques est responsable de l’évolution des protéines pathogènes, et les rend insensibles aux médicaments. Les méthodes actuelles, qui reposent sur des analyses génotypiques de la résistance, ne peuvent anticiper les changements évolutifs, ce qui risque d’entraver l’efficacité des traitements. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie (MSCA), le projet PRERES inaugure une approche prédictive, qui s’appuie sur l’évolution moléculaire et la biologie computationnelle pour anticiper l’évolution des cibles des médicaments contre le VIH-1 et améliorer la sélection des thérapies. Cette recherche offre l’espoir de repousser la résistance aux médicaments et marque une avancée considérable des études sur l’évolution moléculaire.
Objectif
"Drug resistant mutations can appear when the selective pressure given by a pharmacological treatment causes the evolution of
pathogen proteins towards variants that become unaffected by the drug. Currently, to select therapies against pathogens, genotypic
resistance analyses and tables of resistance mutations are employed to decide the best treatment for the patients. However, these
screenings ignore evolutionary changes that can appear as pathogens adapt, potentially leading to drug resistance. To address this
limitation, the prediction of which variants are more probable to occur in the pathogen population can be useful in selecting ""a priori""
therapies active against those variants before their potential expansion toward reservoirs more inaccessible to drugs. In this proposed
work, I will apply molecular evolution and computational structural biology techniques to evaluate the evolutionary trajectories of
HIV-1 drug targets proteins that lead to resistance against common antiretroviral treatments. I will calculate protein fitness landscapes
based on protein folding stability and activity, also considering binding to inhibitors. Next, I will use evolutionary information from
protein fitness landscapes to improve substitution models of evolution. The evolutionary trajectories predicted by combining
substitution models and fitness landscapes will be validated through comparisons with real data from monitored HIV-1 populations
evolved ""in vitro"" and ""in vivo"". Finally, I will focus on calculating the probability of evolutionary trajectories toward resistance
variants. This research has the potential to improve the selection of therapies for pathogens by providing predictive tools that
consider the evolutionary dynamics of these microorganisms. Furthermore, the results of the project have the potential to be a
breakthrough in the field of molecular evolution as this methodology could also be applied to predict the evolution of other
pathogens."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
36310 VIGO PONTEVEDRA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.