Opis projektu
Przewidywanie ewolucji patogenów
Pojawianie się mutacji lekoopornych stanowi ogromne wyzwanie, jeśli chodzi o walkę z patogenami. Selektywna presja ze strony leczenia farmakologicznego stymuluje ewolucję białek patogenów, które stają się odporne na leki. Obecne metody opierające się na analizie oporności genotypowej nie pozwalają na przewidywanie zmian ewolucyjnych, co oznacza ryzyko nieskutecznego leczenia. Wspierany przez program działań „Maria Skłodowska-Curie” (MSCA) projekt PRERES zakłada opracowanie pionierskiego podejścia predykcyjnego, wykorzystującego ewolucję molekularną i biologię obliczeniową do prognozowania ewolucji celów leków HIV-1 i poprawy doboru metody leczenia. Badania te dają nadzieję na uporanie się z opornością na leki, oznaczając znaczący skok w badaniach ewolucji molekularnej.
Cel
"Drug resistant mutations can appear when the selective pressure given by a pharmacological treatment causes the evolution of
pathogen proteins towards variants that become unaffected by the drug. Currently, to select therapies against pathogens, genotypic
resistance analyses and tables of resistance mutations are employed to decide the best treatment for the patients. However, these
screenings ignore evolutionary changes that can appear as pathogens adapt, potentially leading to drug resistance. To address this
limitation, the prediction of which variants are more probable to occur in the pathogen population can be useful in selecting ""a priori""
therapies active against those variants before their potential expansion toward reservoirs more inaccessible to drugs. In this proposed
work, I will apply molecular evolution and computational structural biology techniques to evaluate the evolutionary trajectories of
HIV-1 drug targets proteins that lead to resistance against common antiretroviral treatments. I will calculate protein fitness landscapes
based on protein folding stability and activity, also considering binding to inhibitors. Next, I will use evolutionary information from
protein fitness landscapes to improve substitution models of evolution. The evolutionary trajectories predicted by combining
substitution models and fitness landscapes will be validated through comparisons with real data from monitored HIV-1 populations
evolved ""in vitro"" and ""in vivo"". Finally, I will focus on calculating the probability of evolutionary trajectories toward resistance
variants. This research has the potential to improve the selection of therapies for pathogens by providing predictive tools that
consider the evolutionary dynamics of these microorganisms. Furthermore, the results of the project have the potential to be a
breakthrough in the field of molecular evolution as this methodology could also be applied to predict the evolution of other
pathogens."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia ewolucyjna
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafarmakologia i farmacjaoporność na leki
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkafałdowanie białek
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia molekularnaewolucja molekularna
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia molekularnabiologia strukturalna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
36310 Vigo Pontevedra
Hiszpania