Objectif
Achromobacter species are rapidly emerging Gram-negative opportunistic bacteria intrinsically resistant to several antibiotics and are often the cause of healthcare-associated infections, especially in individuals with compromised immune systems or underlying conditions. Following years of misclassification of Achromobacter spp. isolates combined with complicated species typing, the understanding of the ecology of Achromobacter spp. and their clinical significance is lacking. GEM-SEE-Achro aims to answer the questions regarding the population structure, evolution, adaptation, antibiotic resistance development, and genetic variability of Achromobacter spp. both globally and locally, providing crucial insights into the factors contributing to their prevalence, antimicrobial resistance patterns and potential novel therapy approaches. Analysis of whole genome sequencing (WGS) data allows to disentangle these questions. Therefore, I propose the largest Achromobacter spp. study to date including over 800 WGS encompassing its global diversity sampled from both the environment and infected patients. Employment of a number of bioinformatics analysis methods—gene content difference analysis; single nucleotide variant and mobile genomic element identification and association with population structure; evolutionary and migration rates analysis using Bayesian phylogenetics; and resistance phenotype association with genomic differences—will help to answer the fundamental questions of how these bacteria evolve and adapt to their environment, what are the main differences in genetic composition between the environmental and clinical samples, and how these differences can inform us about the population structure and antibiotic resistance development in Achromobacter spp. The gained knowledge could be generalised and applied to studies of other less studied bacterial pathogens.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
01513 Vilnius
Lituanie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.