Descripción del proyecto
Innovaciones tecnológicas para mejorar la identificación de proteínas
La caracterización de las proteínas producidas por una célula u organismo puede aportar conocimientos básicos sobre los procesos celulares y los mecanismos de las enfermedades. Para ello, se necesitan técnicas de detección y secuenciación de proteínas de molécula única con una gran sensibilidad y especificidad. En el proyecto Plas-ID, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, se pretende superar los retos técnicos relacionados con la lectura de transcritos completos y la identificación de proteínas de baja abundancia con un dispositivo de detección molecular basado en el marcaje específico de aminoácidos en dos colores. El dispositivo se diseñará para ralentizar el movimiento de las proteínas y separarlas por su masa molecular durante la electroforesis. La idea es proporcionar una herramienta diagnóstica para identificar y examinar el papel de isoformas de importancia clínica del factor de crecimiento endotelial vascular.
Objetivo
Single-molecule protein sensing and sequencing technologies are emerging on the horizon as new powerful tools, which ultimate goal is the characterization of the proteome, namely the total set of proteins made by a cell or organism. Despite recent advances, challenges in terms of full-length reads, high throughput and intrinsic complexity related to the larger set of building blocks (i.e. 20 amino acids) still remain. Furthermore, the unambiguous identification of proteins at low concentration is an open issue for conventional techniques, such as Mass Spectroscopy and ELISA. I aim to develop a plasmon-enhanced single-molecule sensing device to track and identify proteins, combining a dual-color amino-acid-specific technique to label the proteins and the enhancement to the fluorescence provided by properly-designed plasmonic nanostructures integrated within a nanochannel-based device. The plasmonic nanochannel is filled with a custom-made gel to slow down the motion of proteins and separate them by their molecular mass during the electrophoretic migration, meanwhile plasmonic nanostructures enhance the fluorescence signals acquired from each individual dual-color labelled protein. I will focus on the optimization of the device and testing its capabilities for the discrimination of clinically-relevant isoforms of Vascular endothelial growth factor (VEGFa) family. I will tackle the challenge of isoforms identification even further, by using the device to discriminate between VEGFa and VEGFb, which differ for only six amino acids at the C termini. Results from this work will provide a technique for the identification and quantification of protein isoforms with single-molecule resolution. Potentially, the use of this diagnostic tool will provide new insight into the role of VEGF isoforms and their up/down regulation into several diseases and in turns, also new avenues for targeted therapeutics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
32000 Haifa
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.