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Deciphering Neurodegenerative Disease with fast 3D imaging & functional nanoscopy

Description du projet

La microscopie multimodale informée par l’IA et la nanoscopie fonctionnelle éclairent les processus pathologiques

Les maladies neurodégénératives comme la maladie de Huntington sont des troubles cérébraux progressifs causés par l’agrégation de protéines entraînant une neurotoxicité. Les processus précoces et les mécanismes sous-jacents restent mal compris. Une séparation aberrante de la phase liquide-liquide a été mise en cause. Le projet QScope, financé par le CER, vise à étudier la base biophysique de la formation et de la toxicité des agrégats ainsi que le rôle de la séparation des phases dans la maladie de Huntington en utilisant des modèles cellulaires et des expériences in vitro. Le projet examinera les variantes de protéines, l’environnement cellulaire, la séparation des phases et la propagation des protéines extracellulaires de type prion. Le développement de la microscopie multimodale informée par l’IA et de la nanoscopie fonctionnelle reposant sur l’imagerie sans étiquette et la coloration virtuelle permettra d’évaluer les propriétés mécaniques et la physiopathologie cellulaire avec un minimum d’interférence.

Objectif

Neurodegenerative diseases are incurable, progressive brain disorders associated with accumulation of aberrant protein aggregates with severe effects on movement and mental functioning. The mechanism leading to neurotoxicity is far from understood, due to our lack of insight into early processes. Recently, aberrant liquid-liquid phase separation has emerged as a new concept to explain protein aggregation in neurodegenerative disease. Here, I will investigate the biophysical basis of the formation of different material states of aggregates, by capitalizing on my expertise at the interface of single-molecule biophysics and quantitative, high-resolution imaging in cells.

I propose to address the following key questions, with the use of cellular models of Huntingtons Disease (HD) complemented with well-controlled in vitro experiments: How do the physico-chemical properties of protein variants and the cellular environment influence aggregation and toxicity? What role does phase separation play in Huntingtons disease? How does prion-like spreading of extracellular protein interfere with local protein assemblies in cells?

HD is caused by a gene defect resulting in aggregation-prone huntingtin protein. The diverse sizes (nm-m) and conformations of the aggregates pose a remarkable challenge, and multiple complementary approaches are needed to unravel their morphology and physico-chemical properties. I will develop multimodal AI-informed quantitative microscopy and functional nanoscopy to decipher how aggregates in neurodegenerative disease form and mature. Importantly, we will work without tags and exploit virtually stained quantitative phase imaging to assess mechanical properties and cell pathophysiology, therefore minimizing interference with aggregation processes. The QScope project is expected to elucidate the role of protein aggregation and phase transitions, relevant for a broad variety of diseases, and to establish new label-free and super-resolution imaging.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Institution d’accueil

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Contribution nette de l'UE
€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (1)