Description du projet
Remettre en question l’idée principale de la vie
Les cellules vivantes utilisent 20 acides aminés pour produire des protéines, mais les cellules antérieures en utilisaient peut-être moins. Cette hypothèse intrigante présente des défis pour l’expérimentation en raison de la complexité de la biologie et des limites des outils actuels. Le projet LIFE-19, financé par le CER, vise à développer une souche bactérienne qui n’utilise que 19 acides aminés en mutant tous les sites du tryptophane (Trp) dans un génome minimal de Mycoplasma. Le projet se déroulera en deux étapes: tout d’abord, l’édition de gènes sera utilisée pour identifier les protéines viables substituées par Trp, puis la combinaison de ces mutations permettra de synthétiser un nouveau génome. Cette recherche nous aidera à mieux comprendre les débuts de l’évolution cellulaire et à remettre en question l’hypothèse selon laquelle la vie nécessite l’ensemble des 20 acides aminés canoniques, faisant ainsi progresser le domaine de la biologie synthétique.
Objectif
This proposal aims to construct a bacterial strain LIFE-19 which relies solely on 19 amino acids to build all its proteins. While all living cells known to human beings produce proteins from the same 20 coded amino acids, the study of origins of life imply that earlier cells may have functioned with a smaller alphabet. This is thought-provoking in the present biological context, wherein each of the 20 serves a distinct and vital role. Although many scientists have engaged in theoretical exercises involving the reduction of this amino acid alphabet, the inherent biological intricacy and a lack of suitable tools have impeded experiments on an organismal level.
This project seeks to mutate all the tryptophan (Trp) protein sites in a minimal Mycoplasma genome template. Trp stands out as both one of the scarcest and one of the evolutionary youngest members of the protein alphabet. Here, we will engineer Trp out of a minimal genome in a 2-stage process. Initially, semi-automated gene editing will target all individual Mycoplasma Trp-sites concurrently, using broad randomization schemes (capitalizing on the PIs expertise). This will allow us to compare Trp dispensability across the proteome and select the most viable Trp-substituted protein variants. Second, the selected mutations will be combined to write a new LIFE-19 genome using a bottom-up synthesis.
LIFE-19 will lay the next steppingstone to our understanding of lifes limits. We will be able to get a glimpse into what cells probably went through billions of years ago, when they teetered on the border between life and nonlife. With the reduced number of building blocks, LIFE-19 will also generate an important step towards a cellular chassis with minimal energetic demands and therefore key inventory in Synthetic Biology research. Overall, this project will challenge the textbook knowledge that life depends on the 20 canonical amino acids, by effectively UNalphabeting the Central Dogma of biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
116 36 Praha 1
Tchéquie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.