Objectif
Enhancers are the central regulators of temporal and spatial gene expression patterns, but how enhancers control their target genes from vast distances remains enigmatic. Individual enhancers do not work in isolation but are embedded into the genomic context, often together with other enhancer elements. The synergy arising from multiple enhancers can activate a target gene across distances that the individual elements cannot bridge. Therefore, the synergy of enhancers plays an essential role in gene regulation, but the nature of this synergy and how it affects gene expression is not understood.
We have recently established a unique synthetic platform that allows for the efficient interrogation of individuals and combinations of enhancers from different distances to a target promoter. We aim to refine this platform by incorporating large-scale analysis to decode distance-dependent activation and enhancer synergy patterns. This rich dataset will form the foundation for our deep-learning approaches to determine the sequence constraints underlying enhancer synergy. Furthermore, we will map the 3D genome changes and examine the role of loop extrusion in synergistic gene activation. In addition, we will determine the activation kinetics at the promoter to reveal how multiple enhancers together control burst kinetics. Finally, we will examine how the addition of other regulatory elements, such as promoters or transposable elements, shape enhancer-promoter communication.
We follow a bottom-up reductionist approach to study gene regulation: we will build gene regulatory landscapes and explore how enhancers navigate the genomic context to activate a target promoter. Ultimately, my mission is to unravel the mechanistic relationship among synergistic enhancers in activating distant target genes, complementing genomics and deep learning endeavours for a comprehensive understanding of gene regulation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1010 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.