Ziel
Enhancers are the central regulators of temporal and spatial gene expression patterns, but how enhancers control their target genes from vast distances remains enigmatic. Individual enhancers do not work in isolation but are embedded into the genomic context, often together with other enhancer elements. The synergy arising from multiple enhancers can activate a target gene across distances that the individual elements cannot bridge. Therefore, the synergy of enhancers plays an essential role in gene regulation, but the nature of this synergy and how it affects gene expression is not understood.
We have recently established a unique synthetic platform that allows for the efficient interrogation of individuals and combinations of enhancers from different distances to a target promoter. We aim to refine this platform by incorporating large-scale analysis to decode distance-dependent activation and enhancer synergy patterns. This rich dataset will form the foundation for our deep-learning approaches to determine the sequence constraints underlying enhancer synergy. Furthermore, we will map the 3D genome changes and examine the role of loop extrusion in synergistic gene activation. In addition, we will determine the activation kinetics at the promoter to reveal how multiple enhancers together control burst kinetics. Finally, we will examine how the addition of other regulatory elements, such as promoters or transposable elements, shape enhancer-promoter communication.
We follow a bottom-up reductionist approach to study gene regulation: we will build gene regulatory landscapes and explore how enhancers navigate the genomic context to activate a target promoter. Ultimately, my mission is to unravel the mechanistic relationship among synergistic enhancers in activating distant target genes, complementing genomics and deep learning endeavours for a comprehensive understanding of gene regulation.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1010 Wien
Österreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.