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Control of RNA Polymerase II and Transcription Factors via IDRs

Objectif

RNA Polymerase II (Pol II) plays a pivotal role in human cellular function, carrying out the complex transcription process. A unique domain sits at the end of Pol II, the C-Terminal Domain (CTD), the phosphorylation of which offers a mechanism of interaction for transcription factors (TFs) that regulate the transcription process. The spatial organization of TFs around Pol II is moderated by the intrinsically disordered regions (IDRs) of the TFs and CTD, and high specificity is required to avoid disease causing defects. However, the exact mechanisms that maintain this environment, and their importance are still unknown. Here we suggest a method for determining crucial Pol II TF interactions by relating electromagnetic imaging to computer simulations. Results will be able to delineate individual amino acids responsible for maintaining the spatial organization of the proteins in vitro. The simulation-based study will be leveraged to explore the tolerance of maintaining these interactions when encountered with different phosphorylation states of CTD. A proof-of-concept study is then described which will demonstrate an ability to actively target IDRs to stabilize the protein interactions. While the results here will be comprehensive for four TFs of interest (RECQL5, SCAF4, SCAF8, and the SOSS1 complex), the methodology can then be expanded to characterize a library of over 400 TFs. Such a project has the potential to not only further our understanding of CTDs function, but also pave a way for designing synthetic treatments that can regulate the transcription process.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-WIDERA-2023-TALENTS-02

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

Masarykova univerzita
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 150 438,72
Adresse
Zerotinovo namesti 9
601 77 Brno
Tchéquie

Voir sur la carte

Région
Česko Jihovýchod Jihomoravský kraj
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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