Descripción del proyecto
El ribosoma en movimiento
Los ribosomas son las máquinas moleculares de la vida. Son como pequeñas fábricas que traducen el código genético en proteínas. Sin embargo, a pesar de décadas de estudio, sus rápidos y dinámicos movimientos siguen siendo difíciles de captar. En este contexto, el proyecto DeepRibosome, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende desarrollar una nueva forma de observar los ribosomas en funcionamiento en tiempo real. En concreto, utilizará la criomicroscopía electrónica en ribosomas activos derivados de células y reconstituidos en un sistema controlado. El proyecto cartografiará estados estructurales fugaces que se producen en apenas milisegundos. Combinado con ensayos funcionales como Ribo-seq, este método vinculará estructura y función con la máxima precisión. El proyecto DeepRibosome promete revelar cómo se adaptan los ribosomas, regulan la traducción y responden a su entorno, incluso bajo estrés por antibióticos.
Objetivo
Structure determination of dynamic macromolecular molecular machines and elucidating their conformational landscapes are fundamental tasks of structural biology. The ribosome as a paradigmatic macromolecular machine interacts with numerous ligands and factors throughout its functional cycles, which in turn are driven and regulated by various conformational modes. Project DeepRibosome proposes a new way to perform structural studies. It is based on our recent finding that E. coli ex-vivo derived polysomes carrying the translatome can be efficiently reactivated in the PURE in vitro translation system. Cryo-EM of actively translating ribosomes results in comprehensive structural landscapes. During steady state, all intermediates are expected to be present, including the short-lived ones. Supported by preliminary data, we estimate that applying multi-particle sorting of images we can resolve states with a lifetime in the one-digit millisecond range. This allows us to study under optimal conditions fast steps such as the GTPase factor-dependent reactions or peptidyl-transfer/accommodation without artificially stalling the reaction by antibiotics or non-cleavable GTP analogues. The structural studies will be accompanied by functional assays including Ribo-seq to monitor translation of the cell-derived translatome in a cell-free system. While, we will also conduct in situ structural analysis for comparison, the strength of our new approach is that we can track translation from an integrated structural and functional perspective, preserving/reconstituting many native features but under defined and controllable conditions. This will not only provide insights into the molecular mechanism of translation at the next level of understanding but also allow us to answer long-standing questions e.g. how exactly the physicochemical environment (temperature, ions) or auxiliary factors impact translation. It will also provide new means to study the inhibition mechanisms of antibiotics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias médicas y de la salud medicina básica farmacología y farmacia medicamento antibióticos
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
10117 Berlin
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.