Projektbeschreibung
Enthüllung des Ribosoms in Bewegung
Ribosomen sind die molekularen Maschinen des Lebens. Sie sind wie winzige Fabriken, die den genetischen Code in Proteine übersetzen. Doch trotz jahrzehntelanger Studien sind ihre schnellen und dynamischen Bewegungen nach wie vor schwer zu erfassen. In diesem Zusammenhang zielt das vom Europäischen Forschungsrat finanzierte DeepRibosome-Projekt darauf ab, eine neue Methode zu entwickeln, um Ribosomen bei ihrer Arbeit in Echtzeit zu beobachten. Konkret wird die Kryo-Elektronenmikroskopie an aktiven, aus Zellen stammenden Ribosomen eingesetzt, die in einem kontrollierten System rekonstituiert wurden. Das Projekt wird flüchtige strukturelle Zustände abbilden, die in wenigen Millisekunden auftreten. In Verbindung mit funktionellen Assays wie Ribo-seq wird dieser Ansatz Struktur und Funktion mit höchster Präzision verbinden. DeepRibosome verspricht Aufschluss darüber zu geben, wie Ribosomen sich anpassen, die Translation regulieren und auf ihre Umgebung reagieren, selbst unter Antibiotikastress.
Ziel
Structure determination of dynamic macromolecular molecular machines and elucidating their conformational landscapes are fundamental tasks of structural biology. The ribosome as a paradigmatic macromolecular machine interacts with numerous ligands and factors throughout its functional cycles, which in turn are driven and regulated by various conformational modes. Project DeepRibosome proposes a new way to perform structural studies. It is based on our recent finding that E. coli ex-vivo derived polysomes carrying the translatome can be efficiently reactivated in the PURE in vitro translation system. Cryo-EM of actively translating ribosomes results in comprehensive structural landscapes. During steady state, all intermediates are expected to be present, including the short-lived ones. Supported by preliminary data, we estimate that applying multi-particle sorting of images we can resolve states with a lifetime in the one-digit millisecond range. This allows us to study under optimal conditions fast steps such as the GTPase factor-dependent reactions or peptidyl-transfer/accommodation without artificially stalling the reaction by antibiotics or non-cleavable GTP analogues. The structural studies will be accompanied by functional assays including Ribo-seq to monitor translation of the cell-derived translatome in a cell-free system. While, we will also conduct in situ structural analysis for comparison, the strength of our new approach is that we can track translation from an integrated structural and functional perspective, preserving/reconstituting many native features but under defined and controllable conditions. This will not only provide insights into the molecular mechanism of translation at the next level of understanding but also allow us to answer long-standing questions e.g. how exactly the physicochemical environment (temperature, ions) or auxiliary factors impact translation. It will also provide new means to study the inhibition mechanisms of antibiotics.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Mikroskopie
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittel Antibiotikum
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-ADG
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenGastgebende Einrichtung
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
10117 Berlin
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.