Description du projet
Comprendre les communautés nitrifiantes dans le traitement des eaux usées
Les interactions microbiennes jouent un rôle dans l’élaboration de la structure et de la fonction des microbiomes dans les stations d’épuration des eaux usées (SEEU), ce qui influe directement sur l’efficacité de ces systèmes. Parmi ces microbes, les nitrifiants (chimiolithoautotrophes et producteurs primaires clés) sont essentiels pour comprendre les flux de carbone inorganique, en particulier lorsqu’ils sont étudiés à l’aide de techniques utilisant des isotopes stables. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet INTERACT utilisera des techniques d’analyse de réseau et de tri cellulaire pour identifier les espèces coexistantes et analyser leurs génomes par métagénomique afin de découvrir des connexions potentielles. Ces connaissances seront confirmées à l’aide de méthodes avancées telles que l’hybridation fluorescente in situ (FISH), le sondage isotopique stable (SIS) et l’imagerie chimique. En mettant en lumière les relations complexes au sein des communautés d’eaux usées, INTERACT vise à fournir des informations précieuses pour la recherche plus large sur le microbiome.
Objectif
Microbial interactions shape the structure, function, and resilience of microbiomes in wastewater treatment plants (WWTPs), directly impacting performance. Nitrifiers, as chemolithoautotrophs and primary producers, are particularly suitable for studying these interactions by assessing carbon flow through metabolite tracing with stable isotopes. This project aims to uncover the principles governing microbial interactions between nitrifiers and their partners through three work packages: identifying interaction partners, inferring their interactions by genome analysis, and verifying these interactions in situ. Potential partners will be identified combining co-occurrence network analyses, fluorescence-activated cell sorting of activated sludge microflocs containing nitrifiers, and amplicon sequencing to identify co-sorted microbes. Fluorescence in situ hybridization (FISH) will be used to confirm their spatial co-localization with nitrifiers. Next, deep long-read metagenomics will generate metagenome-assembled genomes (MAGs) of nitrifiers and their potential partners for genome analysis and metabolic modeling, identifying possible types of interactions. The hypothesized interactions will be verified using FISH and stable isotope probing (SIP) combined with chemical imaging such as mid-infrared photothermal (MIP) imaging and matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) to identify exchanged metabolites in situ. This project is among the first to integrate SIP, FISH, and chemical imaging (MIP and MALDI-MSI) to study microbe-microbe interactions directly in complex microbiomes at the single-cell or cell cluster level. The findings will provide new insights into interaction mechanisms within complex microbiome and help design strategies to promote stable nitrifying communities in WWTPs. The developed workflow will also be highly valuable for studying microbial interactions in other environmental and medical microbiomes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- ingénierie et technologie génie de l'environnement procédés de traitement des eaux procédés de traitement de eau usée
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
- sciences naturelles sciences physiques optique physique des lasers
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1010 Wien
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.