Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Microbial Interactions: Nitrifiers and their Partners in Complex Wastewater Microbiome

Opis projektu

Zrozumienie roli nitryfikatorów w oczyszczaniu ścieków

Wzajemne oddziaływania między drobnoustrojami odgrywają ważną rolę w kształtowaniu struktury i funkcji mikrobiomów charakterystycznych dla oczyszczalni ścieków, bezpośrednio wpływając na skuteczność działania tych instalacji. Wśród tych drobnoustrojów poczesne miejsce zajmują nitryfikatory (chemolitoautotrofy i producenci o kluczowym znaczeniu), których badanie ma podstawowe znaczenie dla zrozumienia przepływu węgla nieorganicznego, zwłaszcza przy użyciu analizy stabilnych izotopów. Korzystając ze wsparcia programu działań „Maria Skłodowska-Curie”, zespół projektu INTERACT wykorzysta analizę sieci i techniki sortowania komórek, aby zidentyfikować współistniejące gatunki, a także dokona analizy ich genomów za pomocą metagenomiki, aby ujawnić potencjalne powiązania. Następnie spostrzeżenia te zostaną potwierdzone przy użyciu zaawansowanych metod, takich jak fluorescencyjna hybrydyzacja in situ (FISH), badanie stabilnych izotopów (SIP) i obrazowanie chemiczne. Dzięki rzuceniu światła na złożone relacje w społecznościach drobnoustrojów bytujących w ściekach projekt INTERACT dostarczy cennej wiedzy na potrzeby szerszych badań nad mikrobiomem.

Cel

Microbial interactions shape the structure, function, and resilience of microbiomes in wastewater treatment plants (WWTPs), directly impacting performance. Nitrifiers, as chemolithoautotrophs and primary producers, are particularly suitable for studying these interactions by assessing carbon flow through metabolite tracing with stable isotopes. This project aims to uncover the principles governing microbial interactions between nitrifiers and their partners through three work packages: identifying interaction partners, inferring their interactions by genome analysis, and verifying these interactions in situ. Potential partners will be identified combining co-occurrence network analyses, fluorescence-activated cell sorting of activated sludge microflocs containing nitrifiers, and amplicon sequencing to identify co-sorted microbes. Fluorescence in situ hybridization (FISH) will be used to confirm their spatial co-localization with nitrifiers. Next, deep long-read metagenomics will generate metagenome-assembled genomes (MAGs) of nitrifiers and their potential partners for genome analysis and metabolic modeling, identifying possible types of interactions. The hypothesized interactions will be verified using FISH and stable isotope probing (SIP) combined with chemical imaging such as mid-infrared photothermal (MIP) imaging and matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) to identify exchanged metabolites in situ. This project is among the first to integrate SIP, FISH, and chemical imaging (MIP and MALDI-MSI) to study microbe-microbe interactions directly in complex microbiomes at the single-cell or cell cluster level. The findings will provide new insights into interaction mechanisms within complex microbiome and help design strategies to promote stable nitrifying communities in WWTPs. The developed workflow will also be highly valuable for studying microbial interactions in other environmental and medical microbiomes.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSITAT WIEN
Wkład UE netto
€ 214 344,72
Koszt całkowity
Brak danych