Descripción del proyecto
La paramutación y los procesos que subyacen a la inestabilidad de los rasgos de los cultivos
La inestabilidad de las características de los cultivos, sobre todo bajo la presión del cambio climático, presenta riesgos para la seguridad alimentaria. Cada vez se reconoce más que los mecanismos epigenéticos contribuyen decisivamente a esta inestabilidad. La paramutación es uno de estos mecanismos, por el que un alelo silenciado puede suprimir a su homólogo activo, generando rasgos inestables a lo largo de las generaciones. Con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto STEM profundizará en nuestra comprensión de cómo influyen las modificaciones epigenéticas específicas en la paramutación. El proyecto se centrará en el gen «booster1» del maíz, explorando diversas hipótesis relacionadas con las interacciones entre la metilación del ADN y las modificaciones represivas de las histonas. Dichos esfuerzos aportarán datos cruciales sobre los mecanismos de paramutación, harán avanzar nuestros conocimientos y ofrecerán posibles estrategias para estabilizar los rasgos deseables de los cultivos con vistas a la resiliencia de la agricultura en el futuro.
Objetivo
Crop trait instability, particularly under climate change, poses a significant challenge to global food security. Epigenetic mechanisms are increasingly recognized as key contributors to this instability. Paramutation, an epigenetic phenomenon where one silenced inducing allele heritably silences its homologous active sensitive counterpart, leads to unstable traits across generations. Despite its implications for breeding, the mechanisms underlying paramutation remain largely elusive. Recent findings from the host lab suggest that specific DNA methylation and histone modification patterns play central roles in this process. Building on these insights, this project investigates how these epigenetic modifications influence paramutation, using the maize booster1 (b1) gene as a model.
The project is structured into two main objectives: First, I will investigate the hypothesis that inactive DNA flanking the sensitive b1 allele facilitates its silencing by the inducing b1 allele. If true, when exposed to the inducing allele, DNA methylation will spread from the inactive flanking DNA into the active b1 sequences, triggering their silencing. To test this, I will generate detailed DNA methylation profiles during key developmental stages using the novel Cas9-targeted long-read sequencing (nCATS) method. Second, I will explore the relationship between DNA methylation and repressive histone modifications, focusing on the order in which these epigenetic marks are established during paramutation. I will also employ the novel dCas12a-SunTag-TET1-system to specifically demethylate the flanking inactive regions of the active b1 allele, and assess its impact on paramutation. These approaches will advance our understanding of paramutation and provide clues on how to stabilise desirable crop traits. This project is a critical step toward my goal of becoming an independent researcher, by deepening my expertise in epigenetics, advanced lab techniques and crucial transferable skills.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
- ciencias agrícolas agricultura, silvicultura y pesca agricultura granos y semillas oleoaginosas cereales
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1012WX Amsterdam
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.