Description du projet
Paramutation et processus à l’origine de l’instabilité des caractères des plantes cultivées
L’instabilité des caractères des cultures, en particulier sous la pression du changement climatique, présente des risques pour la sécurité alimentaire. Les mécanismes épigénétiques sont désormais reconnus comme des facteurs clés de cette instabilité. La paramutation est l’un de ces mécanismes, par lequel un allèle réduit au silence peut supprimer son homologue actif, ce qui entraîne des caractéristiques instables d’une génération à l’autre. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet STEM va approfondir notre compréhension de la manière dont des modifications épigénétiques spécifiques influencent la paramutation. Le projet concentrera ses recherches sur le gène booster1 du maïs et explorera diverses hypothèses liées aux interactions entre la méthylation de l’ADN et les modifications répressives des histones. Ces efforts fourniront des informations cruciales sur les mécanismes de paramutation, faisant progresser nos connaissances et apportant des stratégies potentielles pour stabiliser les caractéristiques souhaitables des cultures afin d’assurer la résilience future de l’agriculture.
Objectif
Crop trait instability, particularly under climate change, poses a significant challenge to global food security. Epigenetic mechanisms are increasingly recognized as key contributors to this instability. Paramutation, an epigenetic phenomenon where one silenced inducing allele heritably silences its homologous active sensitive counterpart, leads to unstable traits across generations. Despite its implications for breeding, the mechanisms underlying paramutation remain largely elusive. Recent findings from the host lab suggest that specific DNA methylation and histone modification patterns play central roles in this process. Building on these insights, this project investigates how these epigenetic modifications influence paramutation, using the maize booster1 (b1) gene as a model.
The project is structured into two main objectives: First, I will investigate the hypothesis that inactive DNA flanking the sensitive b1 allele facilitates its silencing by the inducing b1 allele. If true, when exposed to the inducing allele, DNA methylation will spread from the inactive flanking DNA into the active b1 sequences, triggering their silencing. To test this, I will generate detailed DNA methylation profiles during key developmental stages using the novel Cas9-targeted long-read sequencing (nCATS) method. Second, I will explore the relationship between DNA methylation and repressive histone modifications, focusing on the order in which these epigenetic marks are established during paramutation. I will also employ the novel dCas12a-SunTag-TET1-system to specifically demethylate the flanking inactive regions of the active b1 allele, and assess its impact on paramutation. These approaches will advance our understanding of paramutation and provide clues on how to stabilise desirable crop traits. This project is a critical step toward my goal of becoming an independent researcher, by deepening my expertise in epigenetics, advanced lab techniques and crucial transferable skills.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture céréales et oléagineux céréales
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1012WX Amsterdam
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.