Description du projet
Étude de la dynamique des biofilms par impression bactérienne contrôlée sur des surfaces microstructurées
Les biofilms bactériens sont des communautés de micro-organismes fixées à une surface et enrobées dans des matrices extracellulaires protectrices. Sur les dispositifs médicaux ou les implants, ils peuvent provoquer une infection persistante et sont résistants aux traitements antibiotiques. Sur les équipements industriels, ils peuvent perturber les pipelines et provoquer des détériorations dans les usines de transformation alimentaire. Comprendre la dynamique des biofilms est complexe car les populations contiennent souvent plusieurs espèces bactériennes qui se développent sur des surfaces irrégulières. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet DesiBio vise à étudier l’impact de la forme de la surface et de la distribution spatiale des sous-populations sur le développement du biofilm. Il s’appuiera sur des techniques de microfabrication, de microfluidique et d’impression de gouttelettes pour développer un système de modélisation qui surveille les interactions bactériennes pendant la croissance du biofilm, tout en contrôlant la composition initiale de la communauté et les irrégularités de la micro-surface.
Objectif
Bacterial biofilms–conglomerates of bacteria held together by an extracellular matrix–play a major role in our lives including disrupting medical implants, industrial pipelines, or providing antibiotic tolerance to bacteria deep within biofilms by e.g. limiting antibiotic diffusion. It is imperative we understand biofilm population dynamics to improve both our health and industrial processes. However, biofilms are difficult to study because 1) they often contain multiple bacterial species or multiple genetic variants of a single species that form biofilm subpopulations, where the interactions of subpopulations are controlled by their spatial distribution within the biofilm and 2) they are often found growing on irregular surfaces with nooks and crevices, in contrast to most biofilm models on flat agar surfaces. To understand the biofilm dynamics, and thus to control it, it is crucial to analyze the impact of the surface shape and the spatial distribution of biofilm subpopulations on the biofilm formation and growth. However, we lack tractable methods to do so for several days necessary for a typical biofilm to stabilize. Here we propose a synergistic effort based on years of research by myself (surface irregularity, microfluidics expert) and the Imperial College Host (bacteria printing expert), where we aim to use microfabrication techniques, microfluidics, and droplet printing to develop a system to follow bacterial interactions in a growing biofilm where we control: a) the initial patterning of the community, b) surface irregularities on which the community grows, c) cell-surface interactions. We will work with Prof. Sujit Datta at Caltech (secondment) to follow mutant spread in biofilms in porous beds, and we will work with a Paris-based company Hummink to potentially the results of DesiBio for potential commercialization (non-academic placement).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique des fluides microfluidics
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale implant
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
SW7 2AZ London
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.