Description du projet
Zoom sur le dialogue plante-microbe au niveau de la cellule unique
Tout comme les animaux, les plantes vivent en étroite association avec diverses communautés microbiennes qui colonisent leurs racines et les aident à croître, à absorber les nutriments et à survivre au stress. Ces interactions bénéfiques entre plantes et microbes ne sont pas uniformes, elles varient selon les différents types de cellules racinaires. Jusqu’à présent, la plupart des études ont examiné ces relations au niveau des tissus, sans tenir compte de la complexité et des détails à l’échelle de la cellule unique. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MICROMETER entend transformer notre compréhension de la façon dont les plantes façonnent leurs microbiomes. Les chercheurs s’appuieront sur la multiomique à cellule unique et la transcriptomique spatiale pour identifier et caractériser les réseaux de régulation génétique que les plantes utilisent pour communiquer avec les microbes utiles. Les résultats du projet devraient contribuer à une amélioration durable des cultures.
Objectif
Plant-microbiome interactions are crucial for plant health, promoting growth and enhancing resilience under stress conditions. These interactions are highly heterogeneous, shaped by diverse plant cell types and the complex spatial distribution of microbes. However, our current understanding remains predominantly at the tissue level, lacking the resolution to fully capture this heterogeneity. As a result, the genetic networks that govern how plants foster beneficial microbiomes remain largely unexplored. This Fellowship aims to address these gaps by employing cutting-edge single-cell multiomics and spatial mapping technologies. Using Arabidopsis thaliana and the well-characterized 35-member synthetic microbial community (SynCom35) as model systems, I will integrate single-cell transcriptome and chromatin accessibility assays to map transcriptional and epigenetic changes in root cells in response to microbial colonization. This approach will provide novel insights into the cellular mechanisms and genetic networks underlying plant-microbiome interactions. Additionally, by utilizing and further developing PHYTOMap, a multiplexed 3D spatial gene expression analysis platform, I will simultaneously spatially map plant gene expression and microbiome distribution. By integrating single-cell and spatial omics data, I will reconstitute spatially-resolved plant gene regulatory networks that interact with specific microbiome members. Furthermore, I will functionally characterize these predicted regulatory networks, aiming to lay the foundation for genetic engineering to enhance plant interactions with beneficial microbes, offering new strategies for optimizing plant growth and resilience. Altogether, this research will significantly advance our understanding of plant-microbiome interactions at single-cell and spatial resolutions, providing a foundation for innovative approaches to enhance crop resilience and agricultural sustainability in response to global challenges.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
NR47UH Norwich
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.