Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français fr
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS

Decoding Plant-Microbiome Interactions at Single-Cell and Spatial Resolutions

Description du projet

Zoom sur le dialogue plante-microbe au niveau de la cellule unique

Tout comme les animaux, les plantes vivent en étroite association avec diverses communautés microbiennes qui colonisent leurs racines et les aident à croître, à absorber les nutriments et à survivre au stress. Ces interactions bénéfiques entre plantes et microbes ne sont pas uniformes, elles varient selon les différents types de cellules racinaires. Jusqu’à présent, la plupart des études ont examiné ces relations au niveau des tissus, sans tenir compte de la complexité et des détails à l’échelle de la cellule unique. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MICROMETER entend transformer notre compréhension de la façon dont les plantes façonnent leurs microbiomes. Les chercheurs s’appuieront sur la multiomique à cellule unique et la transcriptomique spatiale pour identifier et caractériser les réseaux de régulation génétique que les plantes utilisent pour communiquer avec les microbes utiles. Les résultats du projet devraient contribuer à une amélioration durable des cultures.

Objectif

Plant-microbiome interactions are crucial for plant health, promoting growth and enhancing resilience under stress conditions. These interactions are highly heterogeneous, shaped by diverse plant cell types and the complex spatial distribution of microbes. However, our current understanding remains predominantly at the tissue level, lacking the resolution to fully capture this heterogeneity. As a result, the genetic networks that govern how plants foster beneficial microbiomes remain largely unexplored. This Fellowship aims to address these gaps by employing cutting-edge single-cell multiomics and spatial mapping technologies. Using Arabidopsis thaliana and the well-characterized 35-member synthetic microbial community (SynCom35) as model systems, I will integrate single-cell transcriptome and chromatin accessibility assays to map transcriptional and epigenetic changes in root cells in response to microbial colonization. This approach will provide novel insights into the cellular mechanisms and genetic networks underlying plant-microbiome interactions. Additionally, by utilizing and further developing PHYTOMap, a multiplexed 3D spatial gene expression analysis platform, I will simultaneously spatially map plant gene expression and microbiome distribution. By integrating single-cell and spatial omics data, I will reconstitute spatially-resolved plant gene regulatory networks that interact with specific microbiome members. Furthermore, I will functionally characterize these predicted regulatory networks, aiming to lay the foundation for genetic engineering to enhance plant interactions with beneficial microbes, offering new strategies for optimizing plant growth and resilience. Altogether, this research will significantly advance our understanding of plant-microbiome interactions at single-cell and spatial resolutions, providing a foundation for innovative approaches to enhance crop resilience and agricultural sustainability in response to global challenges.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

THE SAINSBURY LABORATORY
Contribution nette de l'UE
€ 260 347,92
Adresse
Norwich Research Park, Colney Lane
NR47UH Norwich
Royaume-Uni
Région
East of England East Anglia Breckland and South Norfolk
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
Aucune donnée