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Decoding Plant-Microbiome Interactions at Single-Cell and Spatial Resolutions

Descrizione del progetto

Scoprire il dialogo pianta-microbo a livello di singola cellula

Come gli animali, le piante vivono in stretta associazione con diverse comunità microbiche che colonizzano le loro radici e le aiutano a crescere, assorbire i nutrienti e sopravvivere allo stress. Queste interazioni benefiche tra pianta e microbo non sono uniformi, ma variano tra i diversi tipi di cellule radicali. La maggior parte degli studi condotti finora ha esaminato queste relazioni a livello di tessuto, perdendo la complessità e i dettagli a livello di singola cellula. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MICROMETER intende trasformare la nostra comprensione di come le piante modellano il loro microbioma. I ricercatori utilizzeranno la multiomica delle singole cellule e la trascrittomica spaziale per identificare e caratterizzare le reti di regolazione genica che le piante utilizzano per comunicare con i microbi utili. I risultati del progetto dovrebbero contribuire al miglioramento sostenibile delle colture.

Obiettivo

Plant-microbiome interactions are crucial for plant health, promoting growth and enhancing resilience under stress conditions. These interactions are highly heterogeneous, shaped by diverse plant cell types and the complex spatial distribution of microbes. However, our current understanding remains predominantly at the tissue level, lacking the resolution to fully capture this heterogeneity. As a result, the genetic networks that govern how plants foster beneficial microbiomes remain largely unexplored. This Fellowship aims to address these gaps by employing cutting-edge single-cell multiomics and spatial mapping technologies. Using Arabidopsis thaliana and the well-characterized 35-member synthetic microbial community (SynCom35) as model systems, I will integrate single-cell transcriptome and chromatin accessibility assays to map transcriptional and epigenetic changes in root cells in response to microbial colonization. This approach will provide novel insights into the cellular mechanisms and genetic networks underlying plant-microbiome interactions. Additionally, by utilizing and further developing PHYTOMap, a multiplexed 3D spatial gene expression analysis platform, I will simultaneously spatially map plant gene expression and microbiome distribution. By integrating single-cell and spatial omics data, I will reconstitute spatially-resolved plant gene regulatory networks that interact with specific microbiome members. Furthermore, I will functionally characterize these predicted regulatory networks, aiming to lay the foundation for genetic engineering to enhance plant interactions with beneficial microbes, offering new strategies for optimizing plant growth and resilience. Altogether, this research will significantly advance our understanding of plant-microbiome interactions at single-cell and spatial resolutions, providing a foundation for innovative approaches to enhance crop resilience and agricultural sustainability in response to global challenges.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

THE SAINSBURY LABORATORY
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 260 347,92
Indirizzo
Norwich Research Park, Colney Lane
NR47UH Norwich
Regno Unito

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Regione
East of England East Anglia Breckland and South Norfolk
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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