Descripción del proyecto
Exploración de los mecanismos de defensa de la línea germinal en las especies «Caenorhabditis»
Los elementos transponibles (TE, por sus siglas en inglés) suelen dirigirse a la línea germinal de los organismos. En consecuencia, los ARN asociados a Piwi (Piwi-ARN) en los organismos se defienden de los TE para mantener la integridad de la línea germinal. A pesar de su importancia, se sabe poco sobre el mecanismo que utilizan los organismos para suprimir los TE. Con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto TEvsRNA tiene como objetivo investigar el caso del nematodo «Caenorhabditis plicata», una especie única que perdió su vía Piwi-ARN y en su lugar se basa en nuevas clases de ARN pequeños (ARNp) para silenciar los TE. En primer lugar, estudiará la vía del ARNp a nivel molecular para determinar sus orígenes evolutivos en comparación con otras especies de «Caenorhabditis». También desarrollará un modelo experimental para estudiar las invasiones de TE foráneas en nematodos y examinar el impacto resultante en la arquitectura del genoma.
Objetivo
The germline is the only immortal lineage in animals, making it a target for transposable elements (TEs) to perpetuate themselves at the host's expense. To counter these threats, animals utilize Piwi-interacting RNAs (piRNAs) to suppress TEs and maintain germline integrity. Despite the crucial role of piRNAs, the diversity of mechanisms organisms use to repress parasitic elements remains largely unexplored. To address this, I propose studying an emerging model system, the nematode Caenorhabditis plicata; one of the few Caenorhabditis species that lost the piRNA pathway. Notably, our preliminary results indicate that C. plicata employs novel small RNA (sRNA) classes to silence TEs. My first aim is to dissect the molecular basis of this sRNA pathway and elucidate its evolutionary origins. To do so, I will screen for the underlying molecular component controlling this pathway; firstly by targeting homologs of proteins involved in C. elegans sRNA silencing, and secondly, via EMS mutagenesis to identify mutations that suppress silencing of transgenic reporters. I will then investigate whether the novel sRNA populations are ancestral or a recent innovation by examining independent piRNA loss events across different Caenorhabditis species. Motivated by the natural loss of piRNAs and the widespread transfer of TEs between species, my second aim is to develop an experimental model to study foreign TE invasions in nematodes through heterologous insertions of TEs into mutant worms that are unable to defend against these elements. I will then examine the subsequent impact on genome architecture and explore whether they contribute to genome size expansion. This comprehensive approach will not only teach us how animals protect their germline but also deepen understanding of how biological novelty can arise from the ancient evolutionary arms race between invasive elements and silencing pathways.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1030 WIEN
Austria
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.