Description du projet
Explorer les mécanismes de défense de la lignée germinale chez les espèces de Caenorhabditis
Les éléments transposables (TE pour «transposable elements») ciblent souvent la lignée germinale des organismes. En réponse, les ARN interagissant avec Piwi (ARNpi) dans les organismes se défendent contre les TE pour maintenir l’intégrité de la lignée germinale. Malgré leur importance, nous ne disposons que de peu d’informations sur le mécanisme utilisé par les organismes pour supprimer les TE. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet TEvsRNA s’intéresse au cas du nématode Caenorhabditis plicata, une espèce unique qui a perdu sa voie ARNpi et s’appuie à la place sur de nouvelles classes de petits ARN (ARNp) pour réduire les TE au silence. Tout d’abord, il analysera la voie des ARNp au niveau moléculaire afin de déterminer ses origines évolutives par rapport à d’autres espèces de Caenorhabditis. Il développera également un modèle expérimental pour étudier les invasions de TE étrangers chez les nématodes et examiner l’impact qui en résulte sur l’architecture du génome.
Objectif
The germline is the only immortal lineage in animals, making it a target for transposable elements (TEs) to perpetuate themselves at the host's expense. To counter these threats, animals utilize Piwi-interacting RNAs (piRNAs) to suppress TEs and maintain germline integrity. Despite the crucial role of piRNAs, the diversity of mechanisms organisms use to repress parasitic elements remains largely unexplored. To address this, I propose studying an emerging model system, the nematode Caenorhabditis plicata; one of the few Caenorhabditis species that lost the piRNA pathway. Notably, our preliminary results indicate that C. plicata employs novel small RNA (sRNA) classes to silence TEs. My first aim is to dissect the molecular basis of this sRNA pathway and elucidate its evolutionary origins. To do so, I will screen for the underlying molecular component controlling this pathway; firstly by targeting homologs of proteins involved in C. elegans sRNA silencing, and secondly, via EMS mutagenesis to identify mutations that suppress silencing of transgenic reporters. I will then investigate whether the novel sRNA populations are ancestral or a recent innovation by examining independent piRNA loss events across different Caenorhabditis species. Motivated by the natural loss of piRNAs and the widespread transfer of TEs between species, my second aim is to develop an experimental model to study foreign TE invasions in nematodes through heterologous insertions of TEs into mutant worms that are unable to defend against these elements. I will then examine the subsequent impact on genome architecture and explore whether they contribute to genome size expansion. This comprehensive approach will not only teach us how animals protect their germline but also deepen understanding of how biological novelty can arise from the ancient evolutionary arms race between invasive elements and silencing pathways.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1030 Wien
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.