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Orphan Genes as Drivers of Evolutionary Innovation in Microbial and Bacteriophage Systems

Description du projet

Le rôle des nouveaux gènes dans l’évolution

Les gènes orphelins sont spécifiques à une espèce ou à une lignée. Ils sont le moteur de l’innovation biologique, permettant des adaptations spécifiques à chaque espèce, et représentent jusqu’à 20 % des génomes, des microbes aux primates. Pourtant, la plupart restent non caractérisées et nous savons peu de choses sur la façon dont elles émergent. Financé par le CER, le projet Genovation évaluera l’impact des nouveaux gènes sur la condition des bactéries et des levures, étudiera comment les nouvelles protéines s’intègrent dans les systèmes cellulaires et dévoilera les fonctions des gènes orphelins dans la course à l’armement entre les phages et les bactéries. En combinant l’étude des gènes naturels et synthétiques, Genovation cherche à révéler comment les nouveaux gènes apparaissent, s’intègrent et façonnent l’évolution. Ces résultats offrent des perspectives pour la conception de protéines, l’ingénierie cellulaire et les thérapies à base de phages.

Objectif

Orphan genes, unique to an organism or evolutionary lineage, are fundamental drivers of biological innovation. Representing up to 20% of genomes—from microbes to primates—these novel genes enable species-specific adaptations through their diverse functions. However, most orphan genes remain uncharacterized, and the evolutionary pressures governing their emergence are unknown. Addressing these knowledge gaps is crucial for revealing how novel genetic material shapes evolution and biodiversity, particularly in microbial systems.
The Genovation project aims to transform our understanding of gene birth and evolutionary innovation through three aims:
1. Evaluate the fitness impact of newly emerged genes in bacterial and yeast species.
2. Investigate how novel proteins integrate into cellular systems.
3. Elucidate biological functions of successful gene birth events, focusing on the phage-bacteria arms race—where gene birth is highly prevalent.
We will study both synthetic and natural genes to reveal complementary aspects of orphan gene biology. In Aims 1 and 2, we will use my experience with randomly generated nucleotide sequences to simulate early stages of orphan gene emergence in varied genetic backgrounds. Analyzing fitness changes, physiological effects, and protein interactions will provide insights into the relationships between genetic features, cellular contexts, and gene birth. Aim 3 will leverage the rapid evolution and abundance of orphan genes in viral genomes. By identifying orphan genes affecting the phage life cycle and characterizing their functions, we aim to uncover how these genes shape viral-host dynamics and drive novelty.
This project builds on my expertise in large-scale techniques, microbial and phage genetics, and molecular biology methods. The Genovation project promises to yield insights into the mechanisms of evolutionary innovation, potentially opening new avenues in protein design, cellular engineering, and phage-based therapies.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

TEL AVIV UNIVERSITY
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 498 750,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 498 750,00

Bénéficiaires (1)

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