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Orphan Genes as Drivers of Evolutionary Innovation in Microbial and Bacteriophage Systems

Descrizione del progetto

I nuovi geni e il modo in cui guidano il cambiamento evolutivo

I geni orfani, esclusivi di una specie o di un lignaggio, sono alla base dell’innovazione biologica, consentendo adattamenti specifici per specie e rappresentando fino al 20% dei genomi, dai microbi ai primati; ciononostante, la maggior parte di essi è tuttora sconosciuta, mentre le modalità con cui emergono sono poco chiare. Finanziato dal CER, il progetto Genovation valuterà l’impatto esercitato dai nuovi geni nei batteri e nei lieviti sulla fitness, studierà come le nuove proteine si integrano nei sistemi cellulari e scoprirà le funzioni dei geni orfani nella corsa agli armamenti tra fagi e batteri. Combinando studi sui geni naturali e sintetici, Genovation cerca di svelare il modo in cui i nuovi geni nascono, si integrano e modellano l’evoluzione, offrendo risultati che consentiranno di fornire nuove informazioni sulla progettazione di proteine, l’ingegneria cellulare e le terapie basate sui fagi.

Obiettivo

Orphan genes, unique to an organism or evolutionary lineage, are fundamental drivers of biological innovation. Representing up to 20% of genomes—from microbes to primates—these novel genes enable species-specific adaptations through their diverse functions. However, most orphan genes remain uncharacterized, and the evolutionary pressures governing their emergence are unknown. Addressing these knowledge gaps is crucial for revealing how novel genetic material shapes evolution and biodiversity, particularly in microbial systems.
The Genovation project aims to transform our understanding of gene birth and evolutionary innovation through three aims:
1. Evaluate the fitness impact of newly emerged genes in bacterial and yeast species.
2. Investigate how novel proteins integrate into cellular systems.
3. Elucidate biological functions of successful gene birth events, focusing on the phage-bacteria arms race—where gene birth is highly prevalent.
We will study both synthetic and natural genes to reveal complementary aspects of orphan gene biology. In Aims 1 and 2, we will use my experience with randomly generated nucleotide sequences to simulate early stages of orphan gene emergence in varied genetic backgrounds. Analyzing fitness changes, physiological effects, and protein interactions will provide insights into the relationships between genetic features, cellular contexts, and gene birth. Aim 3 will leverage the rapid evolution and abundance of orphan genes in viral genomes. By identifying orphan genes affecting the phage life cycle and characterizing their functions, we aim to uncover how these genes shape viral-host dynamics and drive novelty.
This project builds on my expertise in large-scale techniques, microbial and phage genetics, and molecular biology methods. The Genovation project promises to yield insights into the mechanisms of evolutionary innovation, potentially opening new avenues in protein design, cellular engineering, and phage-based therapies.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

TEL AVIV UNIVERSITY
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 498 750,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 498 750,00

Beneficiari (1)

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