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TP53 Variant Complexity in Context: Multidimensional Functional Profiling for Precision Oncology

Objectif

The genomic landscape of cancer reveals profound complexity, with tumor cells typically accumulating thousands of mutations. While next-generation sequencing maps these alterations across malignancies, translating mutation catalogs into functional and clinically actionable knowledge remains a critical bottleneck in precision oncology. This challenge is exemplified by TP53, a master regulator of cellular stress responses and the most frequently mutated gene in human cancer. Despite its clinical prominence, most TP53 variants remain uncharacterized, with over 1,000 classified as variants of uncertain significance. This reflects the mechanistic and biological complexity of mutant TP53 dysfunction, spanning loss-of-function, gain-of-function, and dominant-negative effects—each shaped by genetic background, cellular identity, and microenvironmental signals. Existing assays fail to capture this multidimensional complexity, limiting actionable insights for clinical decision-making.
TP53in4D will transform TP53 variant interpretation by developing SWAP-IN, an innovative genomic replacement technology enabling saturation mutagenesis of the endogenous TP53 locus under native regulatory control. Applied across diverse cellular models and genetic backgrounds, and integrated with single-cell transcriptomics and time-resolved phenotypic assays, TP53in4D will (1) map variant effects along all functional axes; (2) define how genetic, cellular, and microenvironmental contexts modulate these effects; and (3) build a mechanistic classification framework linking variants to clinical outcome. The resulting resource will resolve long-standing ambiguities in TP53 interpretation, reveal context-specific therapeutic vulnerabilities, and deliver a validated clinical annotation system. Beyond TP53, SWAP-IN establishes a scalable blueprint for decoding cancer genome variation, bridging the gap between mutation detection and biological understanding in precision oncology.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-ADG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

PHILIPPS UNIVERSITAET MARBURG
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 2 498 711,00
Adresse
BIEGENSTRASSE 10
35037 Marburg
Allemagne

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Région
Hessen Gießen Marburg-Biedenkopf
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (1)