Objetivo
ReadSSB addresses a key bottleneck in genome‑stability research by establishing a topology‑aware, label‑free nanopore method to detect DNA single‑strand breaks (SSBs), map their positions, and quantify gap lengths at the single‑molecule level. SSBs are the most frequent DNA lesions and important disease biomarkers, yet existing assays are indirect, slow, and lack single‑molecule resolution. Beyond detection, ReadSSB provides a controlled testbed for non‑equilibrium polymer physics, where SSBs introduce local discontinuities in dsDNA torsional rigidity and mechanical properties.
Building on evidence that electro-osmotic flow generates torque and nucleates plectonemes that are suppressed by SSBs, we will: (O1) characterize topology-dependent ionic-current signatures for intact vs SSB-containing DNA; (O2) optimize operating regimes to amplify SSB separability; (O3) characterize SSBs on circular plasmids; and (O4) localize SSB position and gap length along individual molecules via the “molecular ping-pong” method.
The methodology integrates DNA nanotechnology for controlled SSB constructs and plasmids, solid-state nanopores with tuned electro-osmotic torque, and data-driven signal processing to extract plectoneme probabilities. Outputs will include a physical model of SSB-governed translocation dynamics, a protocol for SSB mapping and gap-length quantification, and an optimized nanopore platform for high-resolution biomolecule detection.
This project goes beyond the state of the art by converting topology-induced dynamics into actionable readouts of DNA damage without labels, enabling rapid and portable assays. Its outcomes directly support Horizon Europe priorities, EU Mission on Cancer and Europe’s Beating Cancer Plan, by underpinning next-generation diagnostics for treatment monitoring and personalized medicine.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ingeniería y tecnología ingeniería eléctrica, ingeniería electrónica, ingeniería de la información ingeniería electrónica procesamiento de señales
- ingeniería y tecnología nanotecnología
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias médicas y de la salud ciencias de la salud medicina personalizada
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.