Objectif
ReadSSB addresses a key bottleneck in genome‑stability research by establishing a topology‑aware, label‑free nanopore method to detect DNA single‑strand breaks (SSBs), map their positions, and quantify gap lengths at the single‑molecule level. SSBs are the most frequent DNA lesions and important disease biomarkers, yet existing assays are indirect, slow, and lack single‑molecule resolution. Beyond detection, ReadSSB provides a controlled testbed for non‑equilibrium polymer physics, where SSBs introduce local discontinuities in dsDNA torsional rigidity and mechanical properties.
Building on evidence that electro-osmotic flow generates torque and nucleates plectonemes that are suppressed by SSBs, we will: (O1) characterize topology-dependent ionic-current signatures for intact vs SSB-containing DNA; (O2) optimize operating regimes to amplify SSB separability; (O3) characterize SSBs on circular plasmids; and (O4) localize SSB position and gap length along individual molecules via the “molecular ping-pong” method.
The methodology integrates DNA nanotechnology for controlled SSB constructs and plasmids, solid-state nanopores with tuned electro-osmotic torque, and data-driven signal processing to extract plectoneme probabilities. Outputs will include a physical model of SSB-governed translocation dynamics, a protocol for SSB mapping and gap-length quantification, and an optimized nanopore platform for high-resolution biomolecule detection.
This project goes beyond the state of the art by converting topology-induced dynamics into actionable readouts of DNA damage without labels, enabling rapid and portable assays. Its outcomes directly support Horizon Europe priorities, EU Mission on Cancer and Europe’s Beating Cancer Plan, by underpinning next-generation diagnostics for treatment monitoring and personalized medicine.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- ingénierie et technologie génie électrique, génie électronique, génie de l’information ingénierie électronique traitement des signaux
- ingénierie et technologie nanotechnologie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé médecine personnalisée
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.