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RegulatoryTEmbryo: Dissecting the role of regulatory transposable elements in shaping embryonic gene networks

Objectif

The precise regulation of gene expression is essential for embryogenesis. Transposable elements (TEs), often considered genomic parasites, are hypothesised to function as regulatory hubs coordinating gene networks during this critical window, but evidence remains largely correlational. The RegulatoryTEmbryo project will bridge this gap by dissecting the causal impact of regulatory TEs on Arabidopsis thaliana development.

This project moves beyond correlation to establish causation through an integrated experimental strategy. First, I will use a dedicated bioinformatic pipeline and in vivo reporter assays to identify and validate the regulatory function of specific TE families. Second, I will employ multiplexed CRISPR-Cas9 to perform targeted deletions of these families, allowing for a definitive assessment of their impact on embryonic transcription and phenotype. Finally, I will use biochemical assays (EMSA) to mechanistically confirm the underlying transcription factor-TE interactions, and evolutionary approaches to uncover the general principles governing TE-encoded gene regulation in plant embryo patterning.

This research will deliver a new model for the role of TEs as key drivers of developmental gene regulation. Ultimately, it will provide a mechanistic framework for understanding how TE-encoded gene regulatory activity fuels morphological diversity in nature. By integrating advanced cell biology and biochemistry with my expertise in epigenomics, this fellowship will provide the crucial interdisciplinary skills required to launch my career as an independent research leader.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 226 420,56
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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