Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español es
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS

Developing next-generation genetic reporters for detecting horizontal gene transfer

Descripción del proyecto

Dentro de la caja negra de la transferencia horizontal de genes

La transferencia horizontal de genes —el movimiento no sexual de material genético entre organismos distintos— es uno de los principales factores que impulsan la resistencia a los antibióticos, y aún es poco comprendido. Con los métodos experimentales actuales solo se pueden detectar eventos de transferencia completos, por lo que con los modelos matemáticos predictivos no se pueden incorporar los procesos intermedios fugaces que dan forma a la dinámica general. Con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, el equipo del proyecto SCRIPT desarrollará marcadores genéticos de última generación que detecten estos procesos transitorios con resolución unicelular para servir de base a modelos matemáticos predictivos. Mediante la integración de la biología sintética, la microbiología ambiental y la modelización, en SCRIPT se arrojará luz sobre procesos previamente inaccesibles que dan forma a la dinámica ecológica de los elementos genéticos móviles, al tiempo que se proporcionaría información para estrategias específicas destinadas a mitigar la resistencia a los antibióticos.

Objetivo

Accurately predicting the spread of genes in the environment via horizontal gene transfer (HGT) is of critical importance to many societal challenges, such as the antibiotic resistance crisis. Our ability to make effective predictions of environmental HGT dynamics is held back by two key knowledge gaps. First, current methods of measuring HGT cannot detect the transient processes that give rise to HGT dynamics, as they can only detect the end result of successful HGT events. Second, mathematical models for HGT spread do not explicitly incorporate these transient processes, limiting our understanding of exactly how these processes affect the spread and mitigation of mobile genetic elements.

In this project, SCRIPT: SynthetiC Recombinase-based Investigation of Plasmid Transfer, I propose to resolve these knowledge gaps by (1) developing the first set of next-generation genetic reporters that can reliably detect target transient HGT processes at high-throughput, single-cell resolution, and (2) incorporating these processes into mathematical models of HGT and using these updated models to quantify the extent to which these measurements enhance model predictiveness of HGT spread dynamics and mitigation strategies. This project is an interdisciplinary effort that combines techniques from synthetic biology and mathematical modeling with those from environmental microbiology and HGT research.

The outcomes of this project will constitute a major advance in the field of HGT research by enabling the measurement of previously- undetectable processes that are critical in shaping the ecological dynamics of mobile genetic elements. The project will also make an important contribution towards enabling the reliable prediction of the environmental spread of mobile genetic elements carrying antibiotic resistance genes, which will inform targeted strategies to mitigate their spread.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Aportación neta de la UEn
€ 263 393,28
Dirección
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Dinamarca
Región
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
Sin datos

Socios (1)