Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Developing next-generation genetic reporters for detecting horizontal gene transfer

Opis projektu

W czarnej skrzynce poziomego transferu genów

Poziomy transfer genów – niezwiązany z rozmnażaniem płciowym ruch materiału genetycznego między odrębnymi organizmami – jest głównym czynnikiem oporności na antybiotyki i nie jest dobrze poznany. Obecne metody eksperymentalne pozwalają jedynie na wykrywanie zakończonych zdarzeń transferu, dlatego predykcyjne modele matematyczne nie są w stanie uwzględnić subtelnych procesów pośrednich, które kształtują ogólną dynamikę. Dzięki wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt SCRIPT będzie mógł opracować reportery genetyczne nowej generacji, które będą w stanie wykrywać te przejściowe procesy z rozdzielczością pojedynczej komórki, co pozwoli na tworzenie predykcyjnych modeli matematycznych. Łącząc biologię syntetyczną, mikrobiologię środowiskową i modelowanie, zespół SCRIPT rzuci światło na dotychczas niedostępne procesy kształtujące dynamikę ekologiczną mobilnych elementów genetycznych, a także potencjalnie umożliwi opracowanie ukierunkowanych strategii łagodzenia oporności na antybiotyki.

Cel

Accurately predicting the spread of genes in the environment via horizontal gene transfer (HGT) is of critical importance to many societal challenges, such as the antibiotic resistance crisis. Our ability to make effective predictions of environmental HGT dynamics is held back by two key knowledge gaps. First, current methods of measuring HGT cannot detect the transient processes that give rise to HGT dynamics, as they can only detect the end result of successful HGT events. Second, mathematical models for HGT spread do not explicitly incorporate these transient processes, limiting our understanding of exactly how these processes affect the spread and mitigation of mobile genetic elements.

In this project, SCRIPT: SynthetiC Recombinase-based Investigation of Plasmid Transfer, I propose to resolve these knowledge gaps by (1) developing the first set of next-generation genetic reporters that can reliably detect target transient HGT processes at high-throughput, single-cell resolution, and (2) incorporating these processes into mathematical models of HGT and using these updated models to quantify the extent to which these measurements enhance model predictiveness of HGT spread dynamics and mitigation strategies. This project is an interdisciplinary effort that combines techniques from synthetic biology and mathematical modeling with those from environmental microbiology and HGT research.

The outcomes of this project will constitute a major advance in the field of HGT research by enabling the measurement of previously- undetectable processes that are critical in shaping the ecological dynamics of mobile genetic elements. The project will also make an important contribution towards enabling the reliable prediction of the environmental spread of mobile genetic elements carrying antibiotic resistance genes, which will inform targeted strategies to mitigate their spread.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Wkład UE netto
€ 263 393,28
Koszt całkowity
Brak danych

Partnerzy (1)