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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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From Farm to Water to Patient: Genomic Source Attribution of Shiga toxin-producing E. coli.

Objectif

Human infections with Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are rising in the Netherlands and are classified among the zoonoses of highest current risk. Despite decades of investment in food safety surveillance, only about 40% of infections can be linked back to food, leaving the majority of infections without an identified source. This gap points to overlooked environmental pathways, particularly livestock reservoirs and contaminated surface waters, that remain poorly understood. My project will generate the first national, year-long dataset of STEC genomes from humans, underrepresented livestock, and surface waters, combining these data with case-control epidemiology to quantify the contribution of environmental exposures. By applying supervised machine-learning approaches to genomic data, I will be able to attribute infections to their sources with greater accuracy and identify risk factors tied to specific reservoirs rather than broad ecological associations. This integrated approach will move beyond piecemeal surveillance and instead provide a unified picture of how human, animal, and environmental compartments interact to sustain transmission. The results will provide evidence to inform water-quality standards, manure management, and farm biosecurity, while building a model of genomic attribution that can be integrated into national surveillance. In doing so, the fellowship aligns directly with European priorities on zoonotic disease preparedness and sustainable agriculture, ensuring that the outcomes will be relevant not only for the Netherlands but also for other countries facing similar risks. Through this work I aim to close the largest blind spot in STEC epidemiology in the Netherlands, producing insights that are directly relevant for public health policy, food safety, and One Health preparedness across Europe.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSITEIT UTRECHT
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 232 916,16
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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