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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Harnessing comparative genomics for trait specific synthetic plant symbionts - SYNBIONT

Descripción del proyecto

Juego de herramientas de bacterias simbióticas basado en grupos de genes que codifican rasgos de resistencia al estrés

El cambio climático está provocando sequías, olas de calor y enfermedades de las plantas cada vez más graves, lo que pone en peligro la seguridad alimentaria mundial. Las bacterias del suelo que ayudan a las plantas a soportar el estrés constituyen una vía prometedora hacia una agricultura resistente al cambio climático, pero las mezclas microbianas actuales, formadas por comunidades sintéticas, suelen fallar en condiciones reales de campo. Al mismo tiempo, siguen sin aprovecharse en su totalidad los amplios conjuntos de datos genómicos que relacionan los genes bacterianos con los rasgos beneficiosos para las plantas. El equipo del proyecto SYNBIONT, que cuenta con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene como objetivo analizar estos conjuntos de datos para identificar grupos de genes asociados a la resistencia al estrés e integrarlos en un conjunto de herramientas bacterianas versátiles. Este método racional, basado en mecanismos, podría proporcionar herramientas microbianas programables y aptas para su uso en el campo con el fin de proteger los cultivos frente a múltiples factores de estrés climático simultáneos.

Objetivo

Climate change is undermining global food security through intensifying droughts, heat waves, and plant diseases. Microbial symbionts are increasingly recognized as key allies for climate-resilient agriculture, yet current approaches based on synthetic communities (SynComs) often fail under field conditions due to ecological instability. In parallel, comparative genomics has generated vast datasets linking host- and trait-associations for tens of thousands of bacterial genes, resources that remain largely untapped for rational symbiont design.

The SYNBIONT project will harness these datasets to identify “trait cassettes”, gene clusters enriched in plant-associated bacteria and correlated with enhanced resilience to (a)biotic stresses. These cassettes will be integrated into Pseudomonas putida KT2440 (P. putida), followed by controlled Arabidopsis thaliana (A. thaliana) experiments under defined stress regimes. Validated resilience-associated genes will be combined into P. putida carrying 3-5 cassettes, engineered to cope with multiple simultaneous stresses, and benchmarked against traditional SynComs.

Integrated phenotypic, transcriptional, metabolic, and physiological analyses will establish causal links between trait cassettes and plant resilience. This approach shifts the field from correlative observations to mechanism-driven, programmable symbionts. Key deliverables include: (i) a validated “PlantFit” atlas of trait-specific genes for stress resilience, (ii) a library of modular, ready-to-use cassettes for rapid deployment, and (iii) engineered P. putida chassis strains for mechanistic studies and translational agriculture.

My expertise in synthetic biology and functional genomics, combined with the host lab’s strengths in comparative genomics and plant-microbe experimentation, provide the ideal foundation to execute this transformative, interdisciplinary project, as well as translate findings from A. thaliana into crops.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinador

UNIVERSIDAD DE MALAGA
Aportación neta de la UEn
€ 194 074,56
Dirección
AVDA CERVANTES, NUM. 2
29016 MALAGA
España
Región
Sur Andalucía Málaga
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
Sin datos

Socios (1)