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Harnessing comparative genomics for trait specific synthetic plant symbionts - SYNBIONT

Description du projet

Une boîte à outils de bactéries symbiotiques basée sur des groupes de gènes codant pour des caractères de résilience au stress

Le changement climatique entraîne des sécheresses, des vagues de chaleur et des maladies végétales de plus en plus graves, menaçant la sécurité alimentaire mondiale. Les bactéries du sol qui aident les plantes à résister au stress constituent une voie prometteuse vers une agriculture résiliente face au changement climatique, mais les cocktails microbiens actuels, composés de communautés synthétiques, s’avèrent souvent inefficaces dans les conditions réelles de terrain. Parallèlement, d’immenses ensembles de données génomiques établissant un lien entre les gènes bactériens et les caractères bénéfiques pour les plantes restent sous-exploités. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SYNBIONT vise à exploiter ces ensembles de données afin d’identifier des groupes de gènes associés à la résilience au stress et à les intégrer dans une boîte à outils bactérienne polyvalente. Cette approche rationnelle, fondée sur des mécanismes, pourrait contribuer à mettre au point des outils microbiens programmables et adaptés aux conditions de terrain afin de protéger les cultures contre plusieurs stress climatiques simultanés.

Objectif

Climate change is undermining global food security through intensifying droughts, heat waves, and plant diseases. Microbial symbionts are increasingly recognized as key allies for climate-resilient agriculture, yet current approaches based on synthetic communities (SynComs) often fail under field conditions due to ecological instability. In parallel, comparative genomics has generated vast datasets linking host- and trait-associations for tens of thousands of bacterial genes, resources that remain largely untapped for rational symbiont design.

The SYNBIONT project will harness these datasets to identify “trait cassettes”, gene clusters enriched in plant-associated bacteria and correlated with enhanced resilience to (a)biotic stresses. These cassettes will be integrated into Pseudomonas putida KT2440 (P. putida), followed by controlled Arabidopsis thaliana (A. thaliana) experiments under defined stress regimes. Validated resilience-associated genes will be combined into P. putida carrying 3-5 cassettes, engineered to cope with multiple simultaneous stresses, and benchmarked against traditional SynComs.

Integrated phenotypic, transcriptional, metabolic, and physiological analyses will establish causal links between trait cassettes and plant resilience. This approach shifts the field from correlative observations to mechanism-driven, programmable symbionts. Key deliverables include: (i) a validated “PlantFit” atlas of trait-specific genes for stress resilience, (ii) a library of modular, ready-to-use cassettes for rapid deployment, and (iii) engineered P. putida chassis strains for mechanistic studies and translational agriculture.

My expertise in synthetic biology and functional genomics, combined with the host lab’s strengths in comparative genomics and plant-microbe experimentation, provide the ideal foundation to execute this transformative, interdisciplinary project, as well as translate findings from A. thaliana into crops.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSIDAD DE MALAGA
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 194 074,56
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Partenaires (1)

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