Objectif
Cellular RNA localization determines transcript fate by controlling its distribution between chromatin, nucleus and cytoplasm. Studies in animal cells have identified a limited number of sequence motifs linked to compartmentalization, but these motifs are often broadly defined and not readily generalizable across species, cell types or conditions. RNA molecules can adopt diverse spatial structures that are involved in various aspects of RNA metabolism. RNA structure has therefore been proposed as an additional layer that regulates RNA subcellular localization.
I aim to deliver the first comprehensive decoding of RNA localization rules in plants by combining compartment-resolved RNA-seq fractionation, in vivo RNA structure profiling, massively parallel reporter assay (MPRA), and AI-driven analyses. Building on my preliminary compartment-resolved RNA-seq fractionation datasets from chromatin-associated, nuclear and cytosolic fractions under control and cold conditions, I will (1) generate compartment-resolved in vivo RNA secondary-structure maps in Arabidopsis, (2) use MPRA to identify and validate sequence–structure motifs that regulate subcellular localization using both traditional bioinformatic and AI-driven modelling to refine motif discovery. (3) Motifs identified through integrated analysis will be validated in native gene contexts via transient expression in Arabidopsis protoplasts and stable complementation of T-DNA mutants with wild-type and motif-altered constructs. Additionally, I will assess whether these motif-driven localization changes cause measurable phenotypic effects.
The outputs will establish a promising conceptual framework for harnessing RNA localization as a regulatory layer of gene expression in plants. Hosted at the John Innes Centre, I shall benefit from advanced training in RNA biology, molecular genetics and AI-driven analysis, complemented by opportunities to boost my professional visibility, leadership capacity and employability.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
NR4 7UH NORWICH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.