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Towards predictive computational platform for drug solubilization in the gastrointestinal tract

Description du projet

Permettre un criblage in silico efficace de la solubilité intestinale des médicaments

Améliorer la biodisponibilité des principes actifs pharmaceutiques constitue un défi dans le développement de médicaments, en particulier lorsqu’il s’agit de solubiliser des composés lipophiles dans l’intestin grêle, où les lipides et les sels biliaires forment des structures colloïdales. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet ABSOLUTE vise à relever ce défi en créant une plateforme computationnelle destinée à simuler et prédire la solubilisation des médicaments dans des milieux bioréalistes imitant les fluides gastro-intestinaux (GIF). Pour ce faire, il créera des modèles moléculaires Martini 3 essentiels afin d’améliorer le paramétrage des sels biliaires, des médicaments et des composés pharmaceutiques. Ensuite, en simulant des GIF contenant toutes les micelles, vésicules et gouttelettes observées, il surveillera la manière dont les médicaments sont solubilisés dans ces environnements.

Objectif

Improving the oral absorption of poorly water-soluble drug molecules remains one of the major challenges in the pharmaceutical industry. A key bottleneck in this process is the solubilization of administered lipophilic compounds in the small intestines, where bile salts (BS) and lipids assemble into colloidal particles. Therefore, understanding the mechanisms and controlling factors of this process is critical for drug development.
The advent of powerful supercomputers has enabled the integration of in silico techniques into the investigation of complex, realistic systems. However, no existing computational platform explicitly accounts for intermolecular interactions to predict drug solubilization in gastrointestinal fluids (GIF). In this project, I will employ coarse-grained (CG) molecular dynamics (MD) to characterize the particles in GIF, and develop a python based computational platform to predict drug solubilization. The time and size scales involved, and the complexity of multi-component systems, make CG MD the most appropriate modeling tool to my project.
An important initial step will be the development of required molecular models within the widely used and state-of-the-art Martini 3 framework. This task will leverage mine and the supervisor’s expertise to fill an important gap in CG MD bile salts and drug parameterization, and will expand on its own the applicability of CG MD to entire new areas. I will simulate GIF containing all scales of micelles/vesicles/droplets that are experimentally detected but not yet computationally studied in the entire range. Finally, I will be able to follow the solubilization mechanisms of drug molecules in the created GI environments, also leveraging a non-academic placement with an important pharmaceutical partner. Ultimately, this work will enable efficient in silico screening of intestinal drug solubility before in vitro and in vivo studies and guiding the identification of promising candidates for drug discovery.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSIDADE NOVA DE LISBOA
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 239 178,90
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Partenaires (2)

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