Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Towards predictive computational platform for drug solubilization in the gastrointestinal tract

Opis projektu

Umożliwianie efektywnych badań przesiewowych in silico rozpuszczalności leków w jelitach

Poprawa biodostępności aktywnych składników farmaceutycznych stanowi wyzwanie w rozwoju leków, szczególnie gdy wiąże się to z rozpuszczaniem związków lipofilowych w jelicie cienkim, gdzie lipidy i sole żółciowe tworzą struktury koloidalne. Projekt ABSOLUTE, wspierany przez program działania „Maria Skłodowska-Curie”, poszukuje rozwiązania tego problemu poprzez stworzenie platformy obliczeniowej do symulacji i przewidywania rozpuszczalności leków w bioistotnych mediach, które naśladują płyny żołądkowo-jelitowe (GIF). W tym celu zostaną stworzone kluczowe modele molekularne Martini 3, które usprawnią parametryzację soli żółciowych, leków i związków farmaceutycznych. Następnie symulując płyny GIF zawierające wszystkie zaobserwowane micele, pęcherzyki i kropelki, będzie monitorować sposób rozpuszczania leków w tych środowiskach.

Cel

Improving the oral absorption of poorly water-soluble drug molecules remains one of the major challenges in the pharmaceutical industry. A key bottleneck in this process is the solubilization of administered lipophilic compounds in the small intestines, where bile salts (BS) and lipids assemble into colloidal particles. Therefore, understanding the mechanisms and controlling factors of this process is critical for drug development.
The advent of powerful supercomputers has enabled the integration of in silico techniques into the investigation of complex, realistic systems. However, no existing computational platform explicitly accounts for intermolecular interactions to predict drug solubilization in gastrointestinal fluids (GIF). In this project, I will employ coarse-grained (CG) molecular dynamics (MD) to characterize the particles in GIF, and develop a python based computational platform to predict drug solubilization. The time and size scales involved, and the complexity of multi-component systems, make CG MD the most appropriate modeling tool to my project.
An important initial step will be the development of required molecular models within the widely used and state-of-the-art Martini 3 framework. This task will leverage mine and the supervisor’s expertise to fill an important gap in CG MD bile salts and drug parameterization, and will expand on its own the applicability of CG MD to entire new areas. I will simulate GIF containing all scales of micelles/vesicles/droplets that are experimentally detected but not yet computationally studied in the entire range. Finally, I will be able to follow the solubilization mechanisms of drug molecules in the created GI environments, also leveraging a non-academic placement with an important pharmaceutical partner. Ultimately, this work will enable efficient in silico screening of intestinal drug solubility before in vitro and in vivo studies and guiding the identification of promising candidates for drug discovery.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSIDADE NOVA DE LISBOA
Wkład UE netto
€ 239 178,90
Koszt całkowity
Brak danych

Partnerzy (2)