Objetivo
This proposal aims to reveal the structure of the RNA binding domain of the human LRP130 protein, along with the RNA binding specificity for this protein, and the structure of the RNA bound complex.LRP130 is an RNA binding protein that associates with spli ced mRNAs. The protein does not contain any sequence homology with known RNA binding motifs, and therefore is likely to bind RNA through a novel RNA binding fold. LRP130 contains several pentatricopeptide repeat (PPR) motifs; other PPR containing proteins have been shown to bind RNA, and several have been implicated in organellar RNA metabolism. In vivo the majority of the total LRP130 protein is located within mitochondria, where it is directly bound to polyadenylated RNAs. There is also a small fraction w ithin nuclei, bound to mRNAs. In vitro, the RNA binding activity maps to the C-terminal region, and when expressed in E.coli this protein displays a preferential affinity for polypyrimidines. The RNA binding domain of LRP130 will be expressed in E.coli p urified by standard chromatographic techniques, and the structure solved by X-ray crystallography. In addition, the RNA binding specificity of this protein will be determined using in vitro evolution (SELEX) experiments. This will provide a high affinity l igand for crystallisation in complex with the protein, as well as suggesting a consensus sequence for RNA binding that can be used to identify sites of interaction in potential target mRNAs. The structure of the protein-RNA complex will then be solved, aga in by crystallography.LRP130 is the first identified mammalian protein directly bound to mitochondrial RNA in vivo. The structure of the RNA binding domain, with and without RNA bound, will be an important step towards understanding the structural basis fo r the functions of PPR motif proteins, and will potentially provide a molecular explanation for the recently described association of mutations in LRP130 with cytochrome c oxidase deficiency in humans.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ingeniería y tecnología ingeniería de materiales cristales
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica embriología
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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FP6-2002-MOBILITY-12
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinador
LEEDS
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.