Objectif
The outgoing phase: Structural proteomics is a large-scale project to determine a sufficiently large number of structures to be representative of all protein folds. This objective is approached using high-throughput protein preparation and structure determination with X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. My particular interest involves the use of NMR spectroscopy in structural proteomics.
The development of NMR spectroscopy for structural proteomics of Thermotoga maritima is a major focus of the research group of Professor Kurt Wüthrich at The Scripps Research Institute, which forms a part of the Joint Centre for Structural Genomics.
About 60% of T. maritima proteins do not have predicted structural annotations, and their levels of homology to proteins with known structures are lower than 30%. The structurally unpredictable proteins with fewer than 150 amino acid residues will be targets for my structural studies. The structures of proteins exhibiting promising NMR spectra will be determined using NMR spectroscopy. The determined structures will provide a basis for further functional studies. The return phase: Enzymes are of great interest to chemical and pharmaceutical industry as asymmetric catalysts. Humicola lanuginosa lipase (HLL) hydrolyses water-insoluble esters, and is applied as a detergent constituent. The proposed research deals with the studies on structural basis of HLL enantioselectivity.
The enzyme will be in vitro evolved towards improved enantioselectivity by a number of cycles involving:
i) introduction of mutations, and
ii) selection of improved HLL using high-throughput screening method.
The structure of the evolved protein will be studied with NMR spectroscopy. Comparison of the obtained structure with the wild type will reveal structural basis of HLL enantioselectivity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2004-MOBILITY-6
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
OIF - Marie Curie actions-Outgoing International Fellowships
Coordinateur
MULHEIM AN DER RUHR
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.